Protein–RNA interactions for Protein: P55895

RAG2, V(D)J recombination-activating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAG2P55895 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAG2P55895 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAG2P55895 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAG2P55895 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAG2P55895 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAG2P55895 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAG2P55895 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAG2P55895 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAG2P55895 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAG2P55895 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RAG2P55895 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAG2P55895 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAG2P55895 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAG2P55895 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAG2P55895 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAG2P55895 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAG2P55895 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAG2P55895 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAG2P55895 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAG2P55895 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAG2P55895 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAG2P55895 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAG2P55895 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAG2P55895 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAG2P55895 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAG2P55895 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAG2P55895 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAG2P55895 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RAG2P55895 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAG2P55895 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAG2P55895 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAG2P55895 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAG2P55895 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAG2P55895 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAG2P55895 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAG2P55895 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAG2P55895 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAG2P55895 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAG2P55895 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAG2P55895 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAG2P55895 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAG2P55895 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAG2P55895 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAG2P55895 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAG2P55895 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAG2P55895 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAG2P55895 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAG2P55895 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAG2P55895 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAG2P55895 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAG2P55895 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAG2P55895 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAG2P55895 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAG2P55895 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAG2P55895 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RAG2P55895 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAG2P55895 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAG2P55895 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAG2P55895 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAG2P55895 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAG2P55895 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAG2P55895 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RAG2P55895 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAG2P55895 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAG2P55895 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAG2P55895 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAG2P55895 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAG2P55895 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAG2P55895 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAG2P55895 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAG2P55895 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAG2P55895 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAG2P55895 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAG2P55895 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAG2P55895 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAG2P55895 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAG2P55895 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAG2P55895 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RAG2P55895 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RAG2P55895 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAG2P55895 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAG2P55895 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAG2P55895 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAG2P55895 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAG2P55895 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RAG2P55895 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAG2P55895 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAG2P55895 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAG2P55895 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAG2P55895 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAG2P55895 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAG2P55895 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAG2P55895 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAG2P55895 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAG2P55895 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAG2P55895 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAG2P55895 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAG2P55895 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAG2P55895 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAG2P55895 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.3 ms