Protein–RNA interactions for Protein: P55036

PSMD4, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD4P55036 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSMD4P55036 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PSMD4P55036 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSMD4P55036 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSMD4P55036 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSMD4P55036 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSMD4P55036 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSMD4P55036 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSMD4P55036 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSMD4P55036 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSMD4P55036 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSMD4P55036 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PSMD4P55036 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSMD4P55036 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSMD4P55036 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSMD4P55036 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSMD4P55036 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSMD4P55036 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSMD4P55036 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSMD4P55036 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSMD4P55036 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSMD4P55036 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSMD4P55036 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSMD4P55036 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PSMD4P55036 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PSMD4P55036 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PSMD4P55036 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PSMD4P55036 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PSMD4P55036 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSMD4P55036 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PSMD4P55036 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSMD4P55036 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSMD4P55036 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSMD4P55036 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSMD4P55036 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PSMD4P55036 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSMD4P55036 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSMD4P55036 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSMD4P55036 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSMD4P55036 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSMD4P55036 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSMD4P55036 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSMD4P55036 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSMD4P55036 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSMD4P55036 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSMD4P55036 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSMD4P55036 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSMD4P55036 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSMD4P55036 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSMD4P55036 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSMD4P55036 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PSMD4P55036 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSMD4P55036 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PSMD4P55036 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PSMD4P55036 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PSMD4P55036 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSMD4P55036 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSMD4P55036 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSMD4P55036 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSMD4P55036 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSMD4P55036 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PSMD4P55036 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PSMD4P55036 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSMD4P55036 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSMD4P55036 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSMD4P55036 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSMD4P55036 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSMD4P55036 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PSMD4P55036 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PSMD4P55036 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PSMD4P55036 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PSMD4P55036 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSMD4P55036 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSMD4P55036 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSMD4P55036 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSMD4P55036 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSMD4P55036 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSMD4P55036 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSMD4P55036 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSMD4P55036 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSMD4P55036 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSMD4P55036 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSMD4P55036 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSMD4P55036 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSMD4P55036 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSMD4P55036 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSMD4P55036 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSMD4P55036 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSMD4P55036 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSMD4P55036 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PSMD4P55036 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSMD4P55036 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSMD4P55036 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PSMD4P55036 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSMD4P55036 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSMD4P55036 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSMD4P55036 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSMD4P55036 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSMD4P55036 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSMD4P55036 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms