Protein–RNA interactions for Protein: P54821

PRRX1, Paired mesoderm homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX1P54821 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PRRX1P54821 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRRX1P54821 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRRX1P54821 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRRX1P54821 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRRX1P54821 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRRX1P54821 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRRX1P54821 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRRX1P54821 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRRX1P54821 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRRX1P54821 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRRX1P54821 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRRX1P54821 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRRX1P54821 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRRX1P54821 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRRX1P54821 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRRX1P54821 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRRX1P54821 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRRX1P54821 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRRX1P54821 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRRX1P54821 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRRX1P54821 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PRRX1P54821 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRRX1P54821 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRRX1P54821 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRRX1P54821 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PRRX1P54821 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRRX1P54821 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRRX1P54821 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRRX1P54821 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRRX1P54821 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRRX1P54821 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRRX1P54821 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRRX1P54821 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRRX1P54821 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRRX1P54821 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRRX1P54821 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRRX1P54821 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRRX1P54821 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRRX1P54821 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRRX1P54821 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRRX1P54821 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRRX1P54821 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRRX1P54821 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRRX1P54821 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRRX1P54821 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRRX1P54821 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRRX1P54821 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PRRX1P54821 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRRX1P54821 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRRX1P54821 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRRX1P54821 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRRX1P54821 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRRX1P54821 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRRX1P54821 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRRX1P54821 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRRX1P54821 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRRX1P54821 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRRX1P54821 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRRX1P54821 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRRX1P54821 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PRRX1P54821 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRRX1P54821 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRRX1P54821 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRRX1P54821 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRRX1P54821 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRRX1P54821 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRRX1P54821 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRRX1P54821 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRRX1P54821 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRRX1P54821 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRRX1P54821 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRRX1P54821 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PRRX1P54821 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRRX1P54821 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRRX1P54821 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PRRX1P54821 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PRRX1P54821 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRRX1P54821 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRRX1P54821 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRRX1P54821 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRRX1P54821 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRRX1P54821 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRRX1P54821 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRRX1P54821 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRRX1P54821 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRRX1P54821 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRRX1P54821 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PRRX1P54821 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRRX1P54821 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRRX1P54821 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRRX1P54821 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRRX1P54821 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRRX1P54821 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRRX1P54821 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRRX1P54821 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRRX1P54821 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRRX1P54821 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRRX1P54821 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRRX1P54821 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms