Protein–RNA interactions for Protein: P51608

MECP2, Methyl-CpG-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MECP2P51608 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MECP2P51608 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MECP2P51608 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MECP2P51608 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MECP2P51608 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MECP2P51608 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MECP2P51608 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MECP2P51608 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MECP2P51608 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MECP2P51608 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MECP2P51608 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MECP2P51608 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MECP2P51608 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MECP2P51608 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MECP2P51608 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MECP2P51608 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MECP2P51608 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MECP2P51608 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MECP2P51608 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MECP2P51608 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MECP2P51608 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MECP2P51608 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MECP2P51608 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MECP2P51608 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MECP2P51608 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MECP2P51608 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MECP2P51608 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MECP2P51608 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MECP2P51608 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MECP2P51608 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MECP2P51608 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MECP2P51608 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MECP2P51608 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MECP2P51608 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MECP2P51608 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MECP2P51608 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MECP2P51608 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
MECP2P51608 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MECP2P51608 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MECP2P51608 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MECP2P51608 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MECP2P51608 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MECP2P51608 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MECP2P51608 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MECP2P51608 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MECP2P51608 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MECP2P51608 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MECP2P51608 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MECP2P51608 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MECP2P51608 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MECP2P51608 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MECP2P51608 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MECP2P51608 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MECP2P51608 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MECP2P51608 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MECP2P51608 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MECP2P51608 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MECP2P51608 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MECP2P51608 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MECP2P51608 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MECP2P51608 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MECP2P51608 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MECP2P51608 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MECP2P51608 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MECP2P51608 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MECP2P51608 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MECP2P51608 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MECP2P51608 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MECP2P51608 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MECP2P51608 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MECP2P51608 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MECP2P51608 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MECP2P51608 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MECP2P51608 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MECP2P51608 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MECP2P51608 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MECP2P51608 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MECP2P51608 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MECP2P51608 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MECP2P51608 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MECP2P51608 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MECP2P51608 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MECP2P51608 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MECP2P51608 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MECP2P51608 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MECP2P51608 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MECP2P51608 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MECP2P51608 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MECP2P51608 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MECP2P51608 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MECP2P51608 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MECP2P51608 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MECP2P51608 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MECP2P51608 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MECP2P51608 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MECP2P51608 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MECP2P51608 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MECP2P51608 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MECP2P51608 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MECP2P51608 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms