Protein–RNA interactions for Protein: P50991

CCT4, T-complex protein 1 subunit delta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT4P50991 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
CCT4P50991 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
CCT4P50991 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
CCT4P50991 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
CCT4P50991 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
CCT4P50991 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
CCT4P50991 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
CCT4P50991 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
CCT4P50991 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
CCT4P50991 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
CCT4P50991 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
CCT4P50991 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
CCT4P50991 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
CCT4P50991 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
CCT4P50991 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
CCT4P50991 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
CCT4P50991 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
CCT4P50991 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
CCT4P50991 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
CCT4P50991 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
CCT4P50991 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CCT4P50991 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
CCT4P50991 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CCT4P50991 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CCT4P50991 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CCT4P50991 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CCT4P50991 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CCT4P50991 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
CCT4P50991 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CCT4P50991 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CCT4P50991 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CCT4P50991 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CCT4P50991 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CCT4P50991 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CCT4P50991 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CCT4P50991 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CCT4P50991 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
CCT4P50991 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
CCT4P50991 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
CCT4P50991 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
CCT4P50991 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CCT4P50991 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CCT4P50991 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CCT4P50991 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
CCT4P50991 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CCT4P50991 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CCT4P50991 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CCT4P50991 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CCT4P50991 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
CCT4P50991 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CCT4P50991 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
CCT4P50991 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CCT4P50991 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
CCT4P50991 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CCT4P50991 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CCT4P50991 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CCT4P50991 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CCT4P50991 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CCT4P50991 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CCT4P50991 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CCT4P50991 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CCT4P50991 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CCT4P50991 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CCT4P50991 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CCT4P50991 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CCT4P50991 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CCT4P50991 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CCT4P50991 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CCT4P50991 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CCT4P50991 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CCT4P50991 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CCT4P50991 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CCT4P50991 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CCT4P50991 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CCT4P50991 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CCT4P50991 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CCT4P50991 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CCT4P50991 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CCT4P50991 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CCT4P50991 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CCT4P50991 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
CCT4P50991 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
CCT4P50991 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
CCT4P50991 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CCT4P50991 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CCT4P50991 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CCT4P50991 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CCT4P50991 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
CCT4P50991 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CCT4P50991 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CCT4P50991 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CCT4P50991 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CCT4P50991 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CCT4P50991 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CCT4P50991 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CCT4P50991 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CCT4P50991 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CCT4P50991 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CCT4P50991 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CCT4P50991 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms