Protein–RNA interactions for Protein: P50607

TUB, Tubby protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBP50607 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TUBP50607 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TUBP50607 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TUBP50607 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TUBP50607 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TUBP50607 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TUBP50607 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
TUBP50607 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TUBP50607 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TUBP50607 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TUBP50607 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TUBP50607 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
TUBP50607 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TUBP50607 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TUBP50607 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TUBP50607 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
TUBP50607 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TUBP50607 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TUBP50607 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TUBP50607 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TUBP50607 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TUBP50607 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TUBP50607 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TUBP50607 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TUBP50607 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TUBP50607 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TUBP50607 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TUBP50607 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TUBP50607 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TUBP50607 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TUBP50607 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
TUBP50607 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
TUBP50607 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TUBP50607 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TUBP50607 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TUBP50607 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TUBP50607 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TUBP50607 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TUBP50607 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TUBP50607 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TUBP50607 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TUBP50607 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
TUBP50607 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TUBP50607 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TUBP50607 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TUBP50607 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TUBP50607 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TUBP50607 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TUBP50607 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TUBP50607 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
TUBP50607 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TUBP50607 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TUBP50607 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TUBP50607 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TUBP50607 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TUBP50607 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TUBP50607 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TUBP50607 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TUBP50607 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
TUBP50607 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
TUBP50607 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
TUBP50607 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TUBP50607 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TUBP50607 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TUBP50607 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TUBP50607 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TUBP50607 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TUBP50607 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TUBP50607 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
TUBP50607 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TUBP50607 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TUBP50607 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TUBP50607 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TUBP50607 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TUBP50607 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TUBP50607 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TUBP50607 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
TUBP50607 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TUBP50607 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TUBP50607 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TUBP50607 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TUBP50607 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TUBP50607 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TUBP50607 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TUBP50607 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TUBP50607 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TUBP50607 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TUBP50607 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TUBP50607 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TUBP50607 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TUBP50607 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TUBP50607 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TUBP50607 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TUBP50607 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TUBP50607 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TUBP50607 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TUBP50607 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TUBP50607 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TUBP50607 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
TUBP50607 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms