Protein–RNA interactions for Protein: P49908

SELENOP, Selenoprotein P, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOPP49908 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SELENOPP49908 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SELENOPP49908 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SELENOPP49908 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SELENOPP49908 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SELENOPP49908 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SELENOPP49908 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SELENOPP49908 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SELENOPP49908 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SELENOPP49908 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SELENOPP49908 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SELENOPP49908 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SELENOPP49908 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SELENOPP49908 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SELENOPP49908 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SELENOPP49908 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SELENOPP49908 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SELENOPP49908 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SELENOPP49908 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SELENOPP49908 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SELENOPP49908 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SELENOPP49908 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SELENOPP49908 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SELENOPP49908 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SELENOPP49908 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SELENOPP49908 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SELENOPP49908 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SELENOPP49908 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SELENOPP49908 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SELENOPP49908 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SELENOPP49908 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SELENOPP49908 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SELENOPP49908 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SELENOPP49908 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SELENOPP49908 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SELENOPP49908 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SELENOPP49908 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SELENOPP49908 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SELENOPP49908 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SELENOPP49908 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SELENOPP49908 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SELENOPP49908 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SELENOPP49908 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SELENOPP49908 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SELENOPP49908 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SELENOPP49908 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SELENOPP49908 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SELENOPP49908 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SELENOPP49908 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SELENOPP49908 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SELENOPP49908 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SELENOPP49908 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SELENOPP49908 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SELENOPP49908 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SELENOPP49908 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SELENOPP49908 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SELENOPP49908 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SELENOPP49908 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SELENOPP49908 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SELENOPP49908 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SELENOPP49908 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SELENOPP49908 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SELENOPP49908 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SELENOPP49908 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SELENOPP49908 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SELENOPP49908 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SELENOPP49908 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SELENOPP49908 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SELENOPP49908 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SELENOPP49908 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SELENOPP49908 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SELENOPP49908 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SELENOPP49908 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SELENOPP49908 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SELENOPP49908 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SELENOPP49908 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SELENOPP49908 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SELENOPP49908 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SELENOPP49908 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SELENOPP49908 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SELENOPP49908 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SELENOPP49908 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SELENOPP49908 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SELENOPP49908 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SELENOPP49908 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SELENOPP49908 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SELENOPP49908 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SELENOPP49908 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SELENOPP49908 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SELENOPP49908 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SELENOPP49908 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SELENOPP49908 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SELENOPP49908 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SELENOPP49908 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SELENOPP49908 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SELENOPP49908 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SELENOPP49908 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SELENOPP49908 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SELENOPP49908 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SELENOPP49908 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms