Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CENPFP49454 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CENPFP49454 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CENPFP49454 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
CENPFP49454 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CENPFP49454 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CENPFP49454 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CENPFP49454 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CENPFP49454 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CENPFP49454 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC31.51■■■□□ 2.63
CENPFP49454 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
CENPFP49454 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
CENPFP49454 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
CENPFP49454 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
CENPFP49454 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CENPFP49454 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CENPFP49454 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
CENPFP49454 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
CENPFP49454 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC31.44■■■□□ 2.62
CENPFP49454 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CENPFP49454 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
CENPFP49454 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
CENPFP49454 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CENPFP49454 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
CENPFP49454 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
CENPFP49454 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CENPFP49454 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CENPFP49454 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
CENPFP49454 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
CENPFP49454 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
CENPFP49454 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
CENPFP49454 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CENPFP49454 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CENPFP49454 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
CENPFP49454 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
CENPFP49454 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
CENPFP49454 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
CENPFP49454 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
CENPFP49454 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CENPFP49454 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CENPFP49454 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
CENPFP49454 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CENPFP49454 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.6
CENPFP49454 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CENPFP49454 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
CENPFP49454 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CENPFP49454 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CENPFP49454 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
CENPFP49454 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.6
CENPFP49454 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
CENPFP49454 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CENPFP49454 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
CENPFP49454 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CENPFP49454 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CENPFP49454 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
CENPFP49454 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
CENPFP49454 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CENPFP49454 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CENPFP49454 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CENPFP49454 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CENPFP49454 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CENPFP49454 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
CENPFP49454 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.58
CENPFP49454 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CENPFP49454 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CENPFP49454 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CENPFP49454 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CENPFP49454 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CENPFP49454 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
CENPFP49454 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
CENPFP49454 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CENPFP49454 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
CENPFP49454 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CENPFP49454 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
CENPFP49454 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
CENPFP49454 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
CENPFP49454 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CENPFP49454 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CENPFP49454 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
CENPFP49454 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CENPFP49454 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
CENPFP49454 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
CENPFP49454 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CENPFP49454 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CENPFP49454 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CENPFP49454 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CENPFP49454 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CENPFP49454 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CENPFP49454 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
CENPFP49454 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
CENPFP49454 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CENPFP49454 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CENPFP49454 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CENPFP49454 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CENPFP49454 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
CENPFP49454 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
CENPFP49454 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CENPFP49454 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CENPFP49454 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CENPFP49454 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC30.95■■■□□ 2.54
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