Protein–RNA interactions for Protein: P48444

ARCN1, Coatomer subunit delta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARCN1P48444 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ARCN1P48444 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ARCN1P48444 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ARCN1P48444 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ARCN1P48444 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ARCN1P48444 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ARCN1P48444 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ARCN1P48444 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ARCN1P48444 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ARCN1P48444 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ARCN1P48444 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ARCN1P48444 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ARCN1P48444 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ARCN1P48444 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ARCN1P48444 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARCN1P48444 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ARCN1P48444 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
ARCN1P48444 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ARCN1P48444 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ARCN1P48444 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARCN1P48444 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARCN1P48444 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ARCN1P48444 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ARCN1P48444 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARCN1P48444 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARCN1P48444 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARCN1P48444 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARCN1P48444 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARCN1P48444 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARCN1P48444 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARCN1P48444 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARCN1P48444 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARCN1P48444 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARCN1P48444 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARCN1P48444 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARCN1P48444 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARCN1P48444 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARCN1P48444 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARCN1P48444 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
ARCN1P48444 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
ARCN1P48444 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ARCN1P48444 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ARCN1P48444 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ARCN1P48444 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ARCN1P48444 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27■■□□□ 1.91
ARCN1P48444 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ARCN1P48444 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ARCN1P48444 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ARCN1P48444 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
ARCN1P48444 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ARCN1P48444 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ARCN1P48444 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ARCN1P48444 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ARCN1P48444 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ARCN1P48444 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ARCN1P48444 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ARCN1P48444 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ARCN1P48444 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ARCN1P48444 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ARCN1P48444 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ARCN1P48444 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ARCN1P48444 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ARCN1P48444 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
ARCN1P48444 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ARCN1P48444 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARCN1P48444 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARCN1P48444 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
ARCN1P48444 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARCN1P48444 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARCN1P48444 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ARCN1P48444 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ARCN1P48444 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ARCN1P48444 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
ARCN1P48444 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARCN1P48444 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARCN1P48444 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARCN1P48444 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARCN1P48444 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARCN1P48444 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARCN1P48444 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARCN1P48444 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARCN1P48444 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARCN1P48444 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
ARCN1P48444 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARCN1P48444 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARCN1P48444 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARCN1P48444 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ARCN1P48444 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ARCN1P48444 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ARCN1P48444 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARCN1P48444 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARCN1P48444 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARCN1P48444 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARCN1P48444 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARCN1P48444 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARCN1P48444 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARCN1P48444 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
ARCN1P48444 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ARCN1P48444 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARCN1P48444 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms