Protein–RNA interactions for Protein: P42263

GRIA3, Glutamate receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA3P42263 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GRIA3P42263 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GRIA3P42263 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GRIA3P42263 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GRIA3P42263 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GRIA3P42263 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GRIA3P42263 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
GRIA3P42263 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GRIA3P42263 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GRIA3P42263 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GRIA3P42263 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
GRIA3P42263 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GRIA3P42263 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GRIA3P42263 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
GRIA3P42263 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GRIA3P42263 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GRIA3P42263 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GRIA3P42263 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GRIA3P42263 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GRIA3P42263 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GRIA3P42263 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GRIA3P42263 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GRIA3P42263 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GRIA3P42263 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GRIA3P42263 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GRIA3P42263 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GRIA3P42263 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GRIA3P42263 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GRIA3P42263 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GRIA3P42263 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GRIA3P42263 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GRIA3P42263 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GRIA3P42263 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GRIA3P42263 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GRIA3P42263 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GRIA3P42263 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GRIA3P42263 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GRIA3P42263 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GRIA3P42263 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GRIA3P42263 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GRIA3P42263 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GRIA3P42263 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GRIA3P42263 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GRIA3P42263 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GRIA3P42263 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GRIA3P42263 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GRIA3P42263 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GRIA3P42263 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
GRIA3P42263 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GRIA3P42263 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GRIA3P42263 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GRIA3P42263 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GRIA3P42263 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
GRIA3P42263 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GRIA3P42263 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GRIA3P42263 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GRIA3P42263 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GRIA3P42263 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GRIA3P42263 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GRIA3P42263 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GRIA3P42263 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
GRIA3P42263 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GRIA3P42263 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
GRIA3P42263 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GRIA3P42263 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GRIA3P42263 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GRIA3P42263 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
GRIA3P42263 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GRIA3P42263 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GRIA3P42263 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GRIA3P42263 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GRIA3P42263 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GRIA3P42263 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GRIA3P42263 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GRIA3P42263 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GRIA3P42263 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
GRIA3P42263 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GRIA3P42263 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GRIA3P42263 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GRIA3P42263 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GRIA3P42263 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GRIA3P42263 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GRIA3P42263 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GRIA3P42263 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GRIA3P42263 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GRIA3P42263 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GRIA3P42263 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GRIA3P42263 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
GRIA3P42263 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GRIA3P42263 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GRIA3P42263 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GRIA3P42263 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GRIA3P42263 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GRIA3P42263 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GRIA3P42263 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GRIA3P42263 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRIA3P42263 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GRIA3P42263 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GRIA3P42263 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GRIA3P42263 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms