Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GRIA2P42262 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GRIA2P42262 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
GRIA2P42262 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GRIA2P42262 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GRIA2P42262 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GRIA2P42262 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
GRIA2P42262 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
GRIA2P42262 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
GRIA2P42262 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GRIA2P42262 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GRIA2P42262 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GRIA2P42262 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GRIA2P42262 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GRIA2P42262 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GRIA2P42262 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GRIA2P42262 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GRIA2P42262 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GRIA2P42262 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GRIA2P42262 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GRIA2P42262 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
GRIA2P42262 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GRIA2P42262 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GRIA2P42262 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GRIA2P42262 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GRIA2P42262 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GRIA2P42262 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GRIA2P42262 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GRIA2P42262 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GRIA2P42262 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GRIA2P42262 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GRIA2P42262 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GRIA2P42262 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GRIA2P42262 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GRIA2P42262 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GRIA2P42262 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GRIA2P42262 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GRIA2P42262 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
GRIA2P42262 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GRIA2P42262 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GRIA2P42262 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GRIA2P42262 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GRIA2P42262 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GRIA2P42262 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GRIA2P42262 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GRIA2P42262 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GRIA2P42262 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.04
GRIA2P42262 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GRIA2P42262 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GRIA2P42262 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GRIA2P42262 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GRIA2P42262 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GRIA2P42262 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GRIA2P42262 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
GRIA2P42262 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GRIA2P42262 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GRIA2P42262 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GRIA2P42262 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GRIA2P42262 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GRIA2P42262 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GRIA2P42262 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GRIA2P42262 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GRIA2P42262 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GRIA2P42262 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GRIA2P42262 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
GRIA2P42262 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GRIA2P42262 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GRIA2P42262 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GRIA2P42262 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GRIA2P42262 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GRIA2P42262 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GRIA2P42262 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GRIA2P42262 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GRIA2P42262 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GRIA2P42262 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GRIA2P42262 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GRIA2P42262 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GRIA2P42262 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GRIA2P42262 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GRIA2P42262 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GRIA2P42262 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GRIA2P42262 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
GRIA2P42262 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GRIA2P42262 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GRIA2P42262 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GRIA2P42262 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GRIA2P42262 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GRIA2P42262 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GRIA2P42262 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GRIA2P42262 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GRIA2P42262 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GRIA2P42262 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GRIA2P42262 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GRIA2P42262 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GRIA2P42262 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GRIA2P42262 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GRIA2P42262 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GRIA2P42262 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GRIA2P42262 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GRIA2P42262 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms