Protein–RNA interactions for Protein: P35908

KRT2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT2P35908 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
KRT2P35908 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
KRT2P35908 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
KRT2P35908 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
KRT2P35908 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
KRT2P35908 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
KRT2P35908 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
KRT2P35908 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
KRT2P35908 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
KRT2P35908 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
KRT2P35908 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
KRT2P35908 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
KRT2P35908 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
KRT2P35908 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
KRT2P35908 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
KRT2P35908 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
KRT2P35908 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
KRT2P35908 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
KRT2P35908 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
KRT2P35908 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
KRT2P35908 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
KRT2P35908 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
KRT2P35908 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
KRT2P35908 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
KRT2P35908 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
KRT2P35908 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC31.06■■■□□ 2.56
KRT2P35908 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
KRT2P35908 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
KRT2P35908 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
KRT2P35908 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
KRT2P35908 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC31.04■■■□□ 2.56
KRT2P35908 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
KRT2P35908 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
KRT2P35908 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
KRT2P35908 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
KRT2P35908 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
KRT2P35908 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
KRT2P35908 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
KRT2P35908 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
KRT2P35908 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
KRT2P35908 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
KRT2P35908 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
KRT2P35908 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
KRT2P35908 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
KRT2P35908 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
KRT2P35908 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
KRT2P35908 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
KRT2P35908 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
KRT2P35908 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
KRT2P35908 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
KRT2P35908 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
KRT2P35908 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
KRT2P35908 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
KRT2P35908 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
KRT2P35908 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
KRT2P35908 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
KRT2P35908 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
KRT2P35908 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
KRT2P35908 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
KRT2P35908 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
KRT2P35908 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
KRT2P35908 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
KRT2P35908 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
KRT2P35908 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
KRT2P35908 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
KRT2P35908 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
KRT2P35908 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
KRT2P35908 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
KRT2P35908 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
KRT2P35908 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
KRT2P35908 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
KRT2P35908 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
KRT2P35908 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
KRT2P35908 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
KRT2P35908 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
KRT2P35908 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
KRT2P35908 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
KRT2P35908 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
KRT2P35908 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
KRT2P35908 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
KRT2P35908 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
KRT2P35908 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
KRT2P35908 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
KRT2P35908 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
KRT2P35908 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
KRT2P35908 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
KRT2P35908 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
KRT2P35908 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
KRT2P35908 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.73■■■□□ 2.51
KRT2P35908 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
KRT2P35908 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
KRT2P35908 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
KRT2P35908 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
KRT2P35908 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
KRT2P35908 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
KRT2P35908 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
KRT2P35908 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
KRT2P35908 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
KRT2P35908 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
KRT2P35908 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms