Protein–RNA interactions for Protein: P31941

APOBEC3A, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3AP31941 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
APOBEC3AP31941 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
APOBEC3AP31941 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
APOBEC3AP31941 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
APOBEC3AP31941 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOBEC3AP31941 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOBEC3AP31941 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOBEC3AP31941 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOBEC3AP31941 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOBEC3AP31941 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOBEC3AP31941 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOBEC3AP31941 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOBEC3AP31941 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
APOBEC3AP31941 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOBEC3AP31941 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOBEC3AP31941 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOBEC3AP31941 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOBEC3AP31941 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOBEC3AP31941 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOBEC3AP31941 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOBEC3AP31941 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOBEC3AP31941 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
APOBEC3AP31941 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOBEC3AP31941 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOBEC3AP31941 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOBEC3AP31941 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOBEC3AP31941 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOBEC3AP31941 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOBEC3AP31941 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOBEC3AP31941 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOBEC3AP31941 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOBEC3AP31941 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
APOBEC3AP31941 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOBEC3AP31941 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOBEC3AP31941 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOBEC3AP31941 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOBEC3AP31941 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOBEC3AP31941 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOBEC3AP31941 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
APOBEC3AP31941 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOBEC3AP31941 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOBEC3AP31941 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
APOBEC3AP31941 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOBEC3AP31941 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOBEC3AP31941 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOBEC3AP31941 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOBEC3AP31941 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOBEC3AP31941 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOBEC3AP31941 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOBEC3AP31941 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOBEC3AP31941 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOBEC3AP31941 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOBEC3AP31941 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOBEC3AP31941 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOBEC3AP31941 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOBEC3AP31941 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOBEC3AP31941 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOBEC3AP31941 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOBEC3AP31941 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOBEC3AP31941 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOBEC3AP31941 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOBEC3AP31941 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
APOBEC3AP31941 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOBEC3AP31941 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOBEC3AP31941 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOBEC3AP31941 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOBEC3AP31941 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOBEC3AP31941 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOBEC3AP31941 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOBEC3AP31941 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOBEC3AP31941 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOBEC3AP31941 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOBEC3AP31941 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOBEC3AP31941 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOBEC3AP31941 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOBEC3AP31941 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOBEC3AP31941 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOBEC3AP31941 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOBEC3AP31941 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
APOBEC3AP31941 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOBEC3AP31941 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOBEC3AP31941 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOBEC3AP31941 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOBEC3AP31941 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOBEC3AP31941 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOBEC3AP31941 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOBEC3AP31941 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
APOBEC3AP31941 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOBEC3AP31941 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
APOBEC3AP31941 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOBEC3AP31941 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOBEC3AP31941 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOBEC3AP31941 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOBEC3AP31941 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOBEC3AP31941 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOBEC3AP31941 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOBEC3AP31941 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOBEC3AP31941 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOBEC3AP31941 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOBEC3AP31941 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms