Protein–RNA interactions for Protein: P26992

CNTFR, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFRP26992 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNTFRP26992 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNTFRP26992 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CNTFRP26992 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNTFRP26992 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNTFRP26992 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNTFRP26992 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNTFRP26992 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CNTFRP26992 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNTFRP26992 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNTFRP26992 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNTFRP26992 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNTFRP26992 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNTFRP26992 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNTFRP26992 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNTFRP26992 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNTFRP26992 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNTFRP26992 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNTFRP26992 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNTFRP26992 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNTFRP26992 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNTFRP26992 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNTFRP26992 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNTFRP26992 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNTFRP26992 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNTFRP26992 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNTFRP26992 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNTFRP26992 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNTFRP26992 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNTFRP26992 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNTFRP26992 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNTFRP26992 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNTFRP26992 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNTFRP26992 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CNTFRP26992 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CNTFRP26992 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTFRP26992 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTFRP26992 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNTFRP26992 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNTFRP26992 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CNTFRP26992 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNTFRP26992 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNTFRP26992 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CNTFRP26992 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNTFRP26992 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNTFRP26992 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNTFRP26992 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNTFRP26992 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNTFRP26992 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNTFRP26992 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNTFRP26992 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNTFRP26992 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNTFRP26992 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNTFRP26992 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CNTFRP26992 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNTFRP26992 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNTFRP26992 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNTFRP26992 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNTFRP26992 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNTFRP26992 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNTFRP26992 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNTFRP26992 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNTFRP26992 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNTFRP26992 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNTFRP26992 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNTFRP26992 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNTFRP26992 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNTFRP26992 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNTFRP26992 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNTFRP26992 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNTFRP26992 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CNTFRP26992 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CNTFRP26992 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNTFRP26992 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNTFRP26992 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNTFRP26992 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNTFRP26992 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNTFRP26992 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNTFRP26992 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CNTFRP26992 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNTFRP26992 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNTFRP26992 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNTFRP26992 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNTFRP26992 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNTFRP26992 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNTFRP26992 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNTFRP26992 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNTFRP26992 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNTFRP26992 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTFRP26992 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTFRP26992 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTFRP26992 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTFRP26992 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTFRP26992 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTFRP26992 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTFRP26992 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTFRP26992 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTFRP26992 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTFRP26992 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTFRP26992 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms