Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
DNMT1P26358 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC41.47■■■■■ 4.23
DNMT1P26358 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC41.46■■■■■ 4.23
DNMT1P26358 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC41.45■■■■■ 4.23
DNMT1P26358 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC41.45■■■■■ 4.23
DNMT1P26358 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC41.45■■■■■ 4.23
DNMT1P26358 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
DNMT1P26358 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
DNMT1P26358 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
DNMT1P26358 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC41.41■■■■■ 4.22
DNMT1P26358 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
DNMT1P26358 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
DNMT1P26358 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC41.37■■■■■ 4.21
DNMT1P26358 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC41.37■■■■■ 4.21
DNMT1P26358 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC41.36■■■■■ 4.21
DNMT1P26358 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
DNMT1P26358 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.33■■■■■ 4.21
DNMT1P26358 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
DNMT1P26358 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.2
DNMT1P26358 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.2
DNMT1P26358 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC41.31■■■■■ 4.2
DNMT1P26358 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
DNMT1P26358 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
DNMT1P26358 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.3■■■■■ 4.2
DNMT1P26358 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
DNMT1P26358 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC41.29■■■■■ 4.2
DNMT1P26358 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
DNMT1P26358 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
DNMT1P26358 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
DNMT1P26358 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
DNMT1P26358 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
DNMT1P26358 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.26■■■■■ 4.19
DNMT1P26358 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.23■■■■■ 4.19
DNMT1P26358 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
DNMT1P26358 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
DNMT1P26358 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC41.22■■■■■ 4.19
DNMT1P26358 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC41.21■■■■■ 4.19
DNMT1P26358 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC41.19■■■■■ 4.18
DNMT1P26358 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
DNMT1P26358 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
DNMT1P26358 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
DNMT1P26358 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
DNMT1P26358 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC41.16■■■■■ 4.18
DNMT1P26358 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC41.14■■■■■ 4.18
DNMT1P26358 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC41.14■■■■■ 4.18
DNMT1P26358 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.18
DNMT1P26358 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
DNMT1P26358 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
DNMT1P26358 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC41.11■■■■■ 4.17
DNMT1P26358 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
DNMT1P26358 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
DNMT1P26358 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC41.08■■■■■ 4.17
DNMT1P26358 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
DNMT1P26358 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC41.08■■■■■ 4.17
DNMT1P26358 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.07■■■■■ 4.17
DNMT1P26358 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.07■■■■■ 4.17
DNMT1P26358 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.07■■■■■ 4.17
DNMT1P26358 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC41.07■■■■■ 4.17
DNMT1P26358 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.17
DNMT1P26358 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.17
DNMT1P26358 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
DNMT1P26358 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC41.03■■■■■ 4.16
DNMT1P26358 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC41.03■■■■■ 4.16
DNMT1P26358 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
DNMT1P26358 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
DNMT1P26358 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
DNMT1P26358 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
DNMT1P26358 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC41■■■■■ 4.15
DNMT1P26358 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
DNMT1P26358 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC40.99■■■■■ 4.15
DNMT1P26358 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
DNMT1P26358 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC40.97■■■■■ 4.15
DNMT1P26358 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
DNMT1P26358 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
DNMT1P26358 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC40.94■■■■■ 4.14
DNMT1P26358 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
DNMT1P26358 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
DNMT1P26358 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC40.91■■■■■ 4.14
DNMT1P26358 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC40.9■■■■■ 4.14
DNMT1P26358 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC40.89■■■■■ 4.14
DNMT1P26358 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
DNMT1P26358 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
DNMT1P26358 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
DNMT1P26358 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
DNMT1P26358 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.86■■■■■ 4.13
DNMT1P26358 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC40.85■■■■■ 4.13
DNMT1P26358 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
DNMT1P26358 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
DNMT1P26358 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
DNMT1P26358 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
DNMT1P26358 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.13
DNMT1P26358 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
DNMT1P26358 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
DNMT1P26358 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC40.81■■■■■ 4.12
DNMT1P26358 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC40.81■■■■■ 4.12
DNMT1P26358 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC40.81■■■■■ 4.12
DNMT1P26358 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC40.8■■■■■ 4.12
DNMT1P26358 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC40.8■■■■■ 4.12
DNMT1P26358 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
DNMT1P26358 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC40.77■■■■■ 4.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms