Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PRKCHP24723 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRKCHP24723 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRKCHP24723 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRKCHP24723 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRKCHP24723 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRKCHP24723 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRKCHP24723 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRKCHP24723 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRKCHP24723 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRKCHP24723 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRKCHP24723 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PRKCHP24723 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRKCHP24723 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRKCHP24723 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRKCHP24723 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRKCHP24723 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRKCHP24723 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRKCHP24723 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRKCHP24723 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRKCHP24723 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRKCHP24723 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRKCHP24723 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRKCHP24723 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRKCHP24723 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRKCHP24723 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRKCHP24723 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRKCHP24723 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRKCHP24723 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRKCHP24723 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRKCHP24723 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRKCHP24723 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRKCHP24723 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRKCHP24723 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRKCHP24723 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRKCHP24723 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PRKCHP24723 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PRKCHP24723 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PRKCHP24723 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRKCHP24723 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRKCHP24723 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRKCHP24723 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRKCHP24723 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRKCHP24723 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PRKCHP24723 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PRKCHP24723 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PRKCHP24723 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PRKCHP24723 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PRKCHP24723 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRKCHP24723 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRKCHP24723 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRKCHP24723 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRKCHP24723 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRKCHP24723 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PRKCHP24723 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRKCHP24723 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRKCHP24723 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRKCHP24723 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRKCHP24723 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRKCHP24723 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRKCHP24723 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRKCHP24723 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRKCHP24723 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PRKCHP24723 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRKCHP24723 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRKCHP24723 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PRKCHP24723 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRKCHP24723 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRKCHP24723 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRKCHP24723 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRKCHP24723 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRKCHP24723 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRKCHP24723 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRKCHP24723 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRKCHP24723 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRKCHP24723 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRKCHP24723 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRKCHP24723 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PRKCHP24723 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PRKCHP24723 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRKCHP24723 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRKCHP24723 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRKCHP24723 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRKCHP24723 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRKCHP24723 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PRKCHP24723 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRKCHP24723 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRKCHP24723 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRKCHP24723 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRKCHP24723 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRKCHP24723 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PRKCHP24723 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRKCHP24723 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRKCHP24723 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRKCHP24723 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRKCHP24723 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRKCHP24723 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRKCHP24723 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRKCHP24723 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRKCHP24723 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms