Protein–RNA interactions for Protein: P24043

LAMA2, Laminin subunit alpha-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA2P24043 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
LAMA2P24043 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
LAMA2P24043 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
LAMA2P24043 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
LAMA2P24043 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
LAMA2P24043 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
LAMA2P24043 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
LAMA2P24043 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
LAMA2P24043 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
LAMA2P24043 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
LAMA2P24043 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
LAMA2P24043 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
LAMA2P24043 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
LAMA2P24043 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC30.12■■■□□ 2.41
LAMA2P24043 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC30.11■■■□□ 2.41
LAMA2P24043 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
LAMA2P24043 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
LAMA2P24043 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
LAMA2P24043 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
LAMA2P24043 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
LAMA2P24043 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
LAMA2P24043 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
LAMA2P24043 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
LAMA2P24043 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
LAMA2P24043 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
LAMA2P24043 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
LAMA2P24043 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
LAMA2P24043 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
LAMA2P24043 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
LAMA2P24043 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
LAMA2P24043 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
LAMA2P24043 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
LAMA2P24043 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
LAMA2P24043 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
LAMA2P24043 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
LAMA2P24043 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
LAMA2P24043 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
LAMA2P24043 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
LAMA2P24043 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
LAMA2P24043 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
LAMA2P24043 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
LAMA2P24043 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
LAMA2P24043 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
LAMA2P24043 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
LAMA2P24043 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
LAMA2P24043 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
LAMA2P24043 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
LAMA2P24043 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
LAMA2P24043 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
LAMA2P24043 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
LAMA2P24043 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
LAMA2P24043 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
LAMA2P24043 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
LAMA2P24043 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
LAMA2P24043 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
LAMA2P24043 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
LAMA2P24043 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
LAMA2P24043 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
LAMA2P24043 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.84■■■□□ 2.37
LAMA2P24043 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
LAMA2P24043 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
LAMA2P24043 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
LAMA2P24043 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
LAMA2P24043 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
LAMA2P24043 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
LAMA2P24043 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
LAMA2P24043 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
LAMA2P24043 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
LAMA2P24043 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
LAMA2P24043 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
LAMA2P24043 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
LAMA2P24043 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
LAMA2P24043 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
LAMA2P24043 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
LAMA2P24043 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
LAMA2P24043 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
LAMA2P24043 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
LAMA2P24043 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
LAMA2P24043 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
LAMA2P24043 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
LAMA2P24043 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
LAMA2P24043 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
LAMA2P24043 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
LAMA2P24043 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
LAMA2P24043 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
LAMA2P24043 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.68■■■□□ 2.34
LAMA2P24043 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
LAMA2P24043 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
LAMA2P24043 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LAMA2P24043 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LAMA2P24043 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LAMA2P24043 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LAMA2P24043 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
LAMA2P24043 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
LAMA2P24043 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LAMA2P24043 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
LAMA2P24043 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LAMA2P24043 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LAMA2P24043 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LAMA2P24043 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms