Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
VAMP1P23763 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VAMP1P23763 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VAMP1P23763 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VAMP1P23763 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VAMP1P23763 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VAMP1P23763 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VAMP1P23763 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VAMP1P23763 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VAMP1P23763 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VAMP1P23763 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VAMP1P23763 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VAMP1P23763 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VAMP1P23763 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VAMP1P23763 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VAMP1P23763 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VAMP1P23763 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VAMP1P23763 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VAMP1P23763 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VAMP1P23763 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VAMP1P23763 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VAMP1P23763 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VAMP1P23763 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VAMP1P23763 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VAMP1P23763 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
VAMP1P23763 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VAMP1P23763 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VAMP1P23763 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VAMP1P23763 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VAMP1P23763 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VAMP1P23763 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VAMP1P23763 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VAMP1P23763 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VAMP1P23763 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VAMP1P23763 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VAMP1P23763 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VAMP1P23763 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VAMP1P23763 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VAMP1P23763 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VAMP1P23763 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VAMP1P23763 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VAMP1P23763 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
VAMP1P23763 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
VAMP1P23763 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VAMP1P23763 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VAMP1P23763 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VAMP1P23763 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VAMP1P23763 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VAMP1P23763 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VAMP1P23763 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
VAMP1P23763 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VAMP1P23763 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VAMP1P23763 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VAMP1P23763 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VAMP1P23763 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VAMP1P23763 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VAMP1P23763 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VAMP1P23763 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VAMP1P23763 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VAMP1P23763 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VAMP1P23763 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VAMP1P23763 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VAMP1P23763 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VAMP1P23763 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VAMP1P23763 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VAMP1P23763 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VAMP1P23763 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VAMP1P23763 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VAMP1P23763 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VAMP1P23763 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VAMP1P23763 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VAMP1P23763 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VAMP1P23763 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VAMP1P23763 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VAMP1P23763 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VAMP1P23763 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
VAMP1P23763 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VAMP1P23763 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VAMP1P23763 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
VAMP1P23763 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VAMP1P23763 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VAMP1P23763 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VAMP1P23763 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VAMP1P23763 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VAMP1P23763 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VAMP1P23763 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VAMP1P23763 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VAMP1P23763 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VAMP1P23763 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VAMP1P23763 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VAMP1P23763 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VAMP1P23763 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VAMP1P23763 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VAMP1P23763 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VAMP1P23763 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VAMP1P23763 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VAMP1P23763 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VAMP1P23763 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VAMP1P23763 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VAMP1P23763 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms