Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
LMNB1P20700 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
LMNB1P20700 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC33.98■■■■□ 3.03
LMNB1P20700 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
LMNB1P20700 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
LMNB1P20700 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
LMNB1P20700 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
LMNB1P20700 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
LMNB1P20700 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
LMNB1P20700 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
LMNB1P20700 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
LMNB1P20700 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
LMNB1P20700 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
LMNB1P20700 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
LMNB1P20700 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
LMNB1P20700 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
LMNB1P20700 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
LMNB1P20700 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
LMNB1P20700 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
LMNB1P20700 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
LMNB1P20700 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
LMNB1P20700 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
LMNB1P20700 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
LMNB1P20700 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
LMNB1P20700 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC33.82■■■■□ 3
LMNB1P20700 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
LMNB1P20700 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
LMNB1P20700 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
LMNB1P20700 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
LMNB1P20700 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC33.78■■■■□ 3
LMNB1P20700 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
LMNB1P20700 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
LMNB1P20700 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
LMNB1P20700 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
LMNB1P20700 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
LMNB1P20700 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
LMNB1P20700 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
LMNB1P20700 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
LMNB1P20700 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
LMNB1P20700 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
LMNB1P20700 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
LMNB1P20700 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
LMNB1P20700 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
LMNB1P20700 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
LMNB1P20700 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
LMNB1P20700 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
LMNB1P20700 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
LMNB1P20700 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
LMNB1P20700 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
LMNB1P20700 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
LMNB1P20700 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
LMNB1P20700 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC33.69■■■□□ 2.98
LMNB1P20700 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
LMNB1P20700 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
LMNB1P20700 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
LMNB1P20700 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
LMNB1P20700 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
LMNB1P20700 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
LMNB1P20700 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
LMNB1P20700 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
LMNB1P20700 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
LMNB1P20700 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
LMNB1P20700 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
LMNB1P20700 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
LMNB1P20700 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
LMNB1P20700 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
LMNB1P20700 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
LMNB1P20700 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC33.52■■■□□ 2.96
LMNB1P20700 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
LMNB1P20700 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
LMNB1P20700 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
LMNB1P20700 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
LMNB1P20700 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
LMNB1P20700 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
LMNB1P20700 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
LMNB1P20700 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
LMNB1P20700 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
LMNB1P20700 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
LMNB1P20700 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
LMNB1P20700 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
LMNB1P20700 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
LMNB1P20700 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
LMNB1P20700 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
LMNB1P20700 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
LMNB1P20700 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
LMNB1P20700 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
LMNB1P20700 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
LMNB1P20700 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
LMNB1P20700 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
LMNB1P20700 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
LMNB1P20700 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
LMNB1P20700 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
LMNB1P20700 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
LMNB1P20700 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
LMNB1P20700 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
LMNB1P20700 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
LMNB1P20700 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
LMNB1P20700 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
LMNB1P20700 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
LMNB1P20700 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms