Protein–RNA interactions for Protein: P19022

CDH2, Cadherin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH2P19022 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDH2P19022 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDH2P19022 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDH2P19022 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CDH2P19022 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDH2P19022 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDH2P19022 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDH2P19022 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDH2P19022 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDH2P19022 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDH2P19022 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDH2P19022 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CDH2P19022 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDH2P19022 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDH2P19022 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDH2P19022 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDH2P19022 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDH2P19022 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDH2P19022 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDH2P19022 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDH2P19022 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDH2P19022 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CDH2P19022 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDH2P19022 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDH2P19022 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDH2P19022 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDH2P19022 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDH2P19022 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDH2P19022 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CDH2P19022 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDH2P19022 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDH2P19022 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDH2P19022 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDH2P19022 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDH2P19022 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDH2P19022 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDH2P19022 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDH2P19022 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDH2P19022 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDH2P19022 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDH2P19022 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDH2P19022 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDH2P19022 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDH2P19022 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDH2P19022 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDH2P19022 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDH2P19022 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDH2P19022 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDH2P19022 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDH2P19022 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDH2P19022 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDH2P19022 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CDH2P19022 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDH2P19022 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDH2P19022 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDH2P19022 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDH2P19022 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDH2P19022 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDH2P19022 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDH2P19022 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDH2P19022 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDH2P19022 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDH2P19022 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDH2P19022 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDH2P19022 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDH2P19022 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDH2P19022 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDH2P19022 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDH2P19022 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDH2P19022 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDH2P19022 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDH2P19022 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDH2P19022 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDH2P19022 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDH2P19022 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDH2P19022 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDH2P19022 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDH2P19022 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDH2P19022 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDH2P19022 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDH2P19022 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDH2P19022 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDH2P19022 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDH2P19022 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDH2P19022 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDH2P19022 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDH2P19022 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CDH2P19022 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDH2P19022 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDH2P19022 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDH2P19022 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDH2P19022 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDH2P19022 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDH2P19022 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDH2P19022 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDH2P19022 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDH2P19022 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CDH2P19022 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDH2P19022 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDH2P19022 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms