Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRG2P13727 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRG2P13727 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRG2P13727 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRG2P13727 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRG2P13727 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRG2P13727 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRG2P13727 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRG2P13727 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRG2P13727 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRG2P13727 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRG2P13727 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRG2P13727 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRG2P13727 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRG2P13727 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PRG2P13727 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRG2P13727 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRG2P13727 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRG2P13727 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRG2P13727 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRG2P13727 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRG2P13727 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRG2P13727 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRG2P13727 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRG2P13727 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRG2P13727 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRG2P13727 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRG2P13727 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRG2P13727 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRG2P13727 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRG2P13727 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRG2P13727 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRG2P13727 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRG2P13727 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRG2P13727 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PRG2P13727 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRG2P13727 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRG2P13727 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRG2P13727 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRG2P13727 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRG2P13727 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRG2P13727 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRG2P13727 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRG2P13727 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRG2P13727 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRG2P13727 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRG2P13727 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRG2P13727 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PRG2P13727 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRG2P13727 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRG2P13727 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRG2P13727 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRG2P13727 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRG2P13727 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRG2P13727 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRG2P13727 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRG2P13727 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRG2P13727 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRG2P13727 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRG2P13727 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRG2P13727 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRG2P13727 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRG2P13727 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRG2P13727 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PRG2P13727 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRG2P13727 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRG2P13727 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRG2P13727 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRG2P13727 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRG2P13727 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRG2P13727 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRG2P13727 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRG2P13727 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRG2P13727 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRG2P13727 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRG2P13727 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRG2P13727 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRG2P13727 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRG2P13727 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRG2P13727 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRG2P13727 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PRG2P13727 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRG2P13727 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRG2P13727 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRG2P13727 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRG2P13727 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRG2P13727 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRG2P13727 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRG2P13727 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRG2P13727 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRG2P13727 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRG2P13727 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRG2P13727 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRG2P13727 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PRG2P13727 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRG2P13727 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRG2P13727 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRG2P13727 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRG2P13727 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRG2P13727 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 166.5 ms