Protein–RNA interactions for Protein: P13726

F3, Tissue factor, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F3P13726 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
F3P13726 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
F3P13726 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
F3P13726 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
F3P13726 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
F3P13726 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
F3P13726 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
F3P13726 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
F3P13726 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
F3P13726 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
F3P13726 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
F3P13726 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
F3P13726 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
F3P13726 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
F3P13726 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
F3P13726 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
F3P13726 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
F3P13726 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
F3P13726 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
F3P13726 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
F3P13726 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
F3P13726 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
F3P13726 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
F3P13726 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
F3P13726 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
F3P13726 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
F3P13726 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
F3P13726 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
F3P13726 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
F3P13726 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
F3P13726 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
F3P13726 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
F3P13726 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
F3P13726 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
F3P13726 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
F3P13726 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
F3P13726 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
F3P13726 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
F3P13726 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
F3P13726 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
F3P13726 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
F3P13726 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
F3P13726 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
F3P13726 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
F3P13726 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
F3P13726 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
F3P13726 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
F3P13726 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
F3P13726 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
F3P13726 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
F3P13726 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
F3P13726 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
F3P13726 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
F3P13726 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
F3P13726 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
F3P13726 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
F3P13726 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
F3P13726 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
F3P13726 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
F3P13726 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
F3P13726 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
F3P13726 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
F3P13726 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
F3P13726 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
F3P13726 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
F3P13726 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
F3P13726 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
F3P13726 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
F3P13726 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
F3P13726 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
F3P13726 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
F3P13726 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
F3P13726 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
F3P13726 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
F3P13726 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
F3P13726 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
F3P13726 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
F3P13726 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
F3P13726 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
F3P13726 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
F3P13726 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
F3P13726 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
F3P13726 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
F3P13726 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
F3P13726 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
F3P13726 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
F3P13726 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
F3P13726 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
F3P13726 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
F3P13726 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
F3P13726 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
F3P13726 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
F3P13726 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
F3P13726 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
F3P13726 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
F3P13726 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
F3P13726 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
F3P13726 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
F3P13726 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
F3P13726 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms