Protein–RNA interactions for Protein: P13682

ZNF35, Zinc finger protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF35P13682 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF35P13682 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF35P13682 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF35P13682 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF35P13682 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF35P13682 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF35P13682 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF35P13682 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF35P13682 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF35P13682 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF35P13682 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF35P13682 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF35P13682 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF35P13682 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF35P13682 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF35P13682 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF35P13682 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF35P13682 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF35P13682 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF35P13682 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF35P13682 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF35P13682 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF35P13682 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF35P13682 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF35P13682 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF35P13682 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF35P13682 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF35P13682 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF35P13682 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF35P13682 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF35P13682 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF35P13682 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF35P13682 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF35P13682 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF35P13682 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF35P13682 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF35P13682 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF35P13682 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF35P13682 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF35P13682 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF35P13682 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF35P13682 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF35P13682 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF35P13682 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF35P13682 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF35P13682 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF35P13682 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF35P13682 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF35P13682 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF35P13682 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF35P13682 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF35P13682 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF35P13682 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF35P13682 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF35P13682 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF35P13682 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF35P13682 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF35P13682 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZNF35P13682 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF35P13682 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF35P13682 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF35P13682 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF35P13682 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF35P13682 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF35P13682 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF35P13682 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF35P13682 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF35P13682 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF35P13682 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF35P13682 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF35P13682 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF35P13682 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF35P13682 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF35P13682 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF35P13682 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZNF35P13682 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZNF35P13682 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF35P13682 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF35P13682 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF35P13682 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF35P13682 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF35P13682 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF35P13682 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF35P13682 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF35P13682 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF35P13682 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF35P13682 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF35P13682 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF35P13682 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF35P13682 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF35P13682 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF35P13682 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF35P13682 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF35P13682 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF35P13682 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF35P13682 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF35P13682 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF35P13682 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF35P13682 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF35P13682 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms