Protein–RNA interactions for Protein: P13631

RARG, Retinoic acid receptor gamma, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARGP13631 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RARGP13631 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RARGP13631 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RARGP13631 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RARGP13631 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RARGP13631 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RARGP13631 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RARGP13631 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RARGP13631 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RARGP13631 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RARGP13631 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RARGP13631 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RARGP13631 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RARGP13631 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
RARGP13631 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
RARGP13631 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RARGP13631 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RARGP13631 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RARGP13631 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RARGP13631 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RARGP13631 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RARGP13631 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RARGP13631 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
RARGP13631 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RARGP13631 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RARGP13631 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RARGP13631 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RARGP13631 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RARGP13631 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RARGP13631 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RARGP13631 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RARGP13631 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RARGP13631 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RARGP13631 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RARGP13631 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RARGP13631 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RARGP13631 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RARGP13631 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RARGP13631 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RARGP13631 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RARGP13631 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RARGP13631 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RARGP13631 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RARGP13631 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RARGP13631 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RARGP13631 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RARGP13631 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RARGP13631 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RARGP13631 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RARGP13631 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RARGP13631 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RARGP13631 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RARGP13631 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RARGP13631 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RARGP13631 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RARGP13631 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RARGP13631 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RARGP13631 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RARGP13631 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RARGP13631 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RARGP13631 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
RARGP13631 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RARGP13631 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RARGP13631 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RARGP13631 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RARGP13631 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RARGP13631 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RARGP13631 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RARGP13631 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RARGP13631 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RARGP13631 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RARGP13631 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RARGP13631 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RARGP13631 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RARGP13631 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RARGP13631 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RARGP13631 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RARGP13631 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RARGP13631 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RARGP13631 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RARGP13631 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RARGP13631 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RARGP13631 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RARGP13631 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RARGP13631 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
RARGP13631 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RARGP13631 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RARGP13631 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
RARGP13631 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RARGP13631 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RARGP13631 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RARGP13631 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RARGP13631 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RARGP13631 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RARGP13631 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RARGP13631 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RARGP13631 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
RARGP13631 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
RARGP13631 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
RARGP13631 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms