Protein–RNA interactions for Protein: P11055

MYH3, Myosin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH3P11055 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
MYH3P11055 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC34.05■■■■□ 3.04
MYH3P11055 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
MYH3P11055 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
MYH3P11055 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
MYH3P11055 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
MYH3P11055 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
MYH3P11055 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
MYH3P11055 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
MYH3P11055 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
MYH3P11055 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
MYH3P11055 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
MYH3P11055 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
MYH3P11055 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
MYH3P11055 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
MYH3P11055 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC33.96■■■■□ 3.03
MYH3P11055 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
MYH3P11055 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
MYH3P11055 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
MYH3P11055 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
MYH3P11055 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
MYH3P11055 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
MYH3P11055 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
MYH3P11055 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
MYH3P11055 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
MYH3P11055 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
MYH3P11055 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
MYH3P11055 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
MYH3P11055 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
MYH3P11055 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
MYH3P11055 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
MYH3P11055 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
MYH3P11055 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
MYH3P11055 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
MYH3P11055 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
MYH3P11055 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
MYH3P11055 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
MYH3P11055 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
MYH3P11055 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
MYH3P11055 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
MYH3P11055 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
MYH3P11055 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
MYH3P11055 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
MYH3P11055 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
MYH3P11055 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC33.79■■■■□ 3
MYH3P11055 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
MYH3P11055 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
MYH3P11055 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
MYH3P11055 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
MYH3P11055 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
MYH3P11055 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
MYH3P11055 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
MYH3P11055 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
MYH3P11055 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
MYH3P11055 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
MYH3P11055 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
MYH3P11055 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
MYH3P11055 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
MYH3P11055 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
MYH3P11055 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
MYH3P11055 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
MYH3P11055 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
MYH3P11055 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
MYH3P11055 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
MYH3P11055 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
MYH3P11055 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
MYH3P11055 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
MYH3P11055 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
MYH3P11055 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
MYH3P11055 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
MYH3P11055 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
MYH3P11055 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
MYH3P11055 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
MYH3P11055 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
MYH3P11055 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
MYH3P11055 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
MYH3P11055 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
MYH3P11055 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
MYH3P11055 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
MYH3P11055 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
MYH3P11055 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
MYH3P11055 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
MYH3P11055 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
MYH3P11055 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
MYH3P11055 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.97
MYH3P11055 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
MYH3P11055 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
MYH3P11055 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
MYH3P11055 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC33.56■■■□□ 2.96
MYH3P11055 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
MYH3P11055 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
MYH3P11055 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
MYH3P11055 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
MYH3P11055 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
MYH3P11055 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
MYH3P11055 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
MYH3P11055 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
MYH3P11055 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
MYH3P11055 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
MYH3P11055 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms