Protein–RNA interactions for Protein: P10451

SPP1, Osteopontin, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPP1P10451 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPP1P10451 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPP1P10451 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPP1P10451 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPP1P10451 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPP1P10451 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPP1P10451 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPP1P10451 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPP1P10451 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPP1P10451 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPP1P10451 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPP1P10451 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPP1P10451 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPP1P10451 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPP1P10451 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPP1P10451 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPP1P10451 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPP1P10451 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPP1P10451 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPP1P10451 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPP1P10451 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPP1P10451 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SPP1P10451 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SPP1P10451 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPP1P10451 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPP1P10451 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPP1P10451 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPP1P10451 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPP1P10451 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPP1P10451 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPP1P10451 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPP1P10451 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPP1P10451 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPP1P10451 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPP1P10451 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPP1P10451 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPP1P10451 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPP1P10451 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPP1P10451 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPP1P10451 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPP1P10451 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPP1P10451 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPP1P10451 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPP1P10451 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPP1P10451 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPP1P10451 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPP1P10451 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPP1P10451 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPP1P10451 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPP1P10451 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPP1P10451 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPP1P10451 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPP1P10451 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPP1P10451 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPP1P10451 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPP1P10451 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPP1P10451 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPP1P10451 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPP1P10451 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPP1P10451 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SPP1P10451 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SPP1P10451 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPP1P10451 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPP1P10451 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPP1P10451 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPP1P10451 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPP1P10451 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPP1P10451 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPP1P10451 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPP1P10451 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPP1P10451 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPP1P10451 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPP1P10451 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPP1P10451 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPP1P10451 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPP1P10451 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPP1P10451 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPP1P10451 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPP1P10451 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SPP1P10451 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPP1P10451 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPP1P10451 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPP1P10451 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPP1P10451 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPP1P10451 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPP1P10451 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPP1P10451 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPP1P10451 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPP1P10451 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPP1P10451 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPP1P10451 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPP1P10451 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPP1P10451 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPP1P10451 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPP1P10451 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPP1P10451 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPP1P10451 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPP1P10451 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPP1P10451 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPP1P10451 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms