Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC172P0C7W6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC172P0C7W6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC172P0C7W6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC172P0C7W6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC172P0C7W6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC172P0C7W6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC172P0C7W6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC172P0C7W6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC172P0C7W6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC172P0C7W6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC172P0C7W6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC172P0C7W6 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC172P0C7W6 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC172P0C7W6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC172P0C7W6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC172P0C7W6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC172P0C7W6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC172P0C7W6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC172P0C7W6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC172P0C7W6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC172P0C7W6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC172P0C7W6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC172P0C7W6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC172P0C7W6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC172P0C7W6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC172P0C7W6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC172P0C7W6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC172P0C7W6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC172P0C7W6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC172P0C7W6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC172P0C7W6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC172P0C7W6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC172P0C7W6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CCDC172P0C7W6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC172P0C7W6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC172P0C7W6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC172P0C7W6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC172P0C7W6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC172P0C7W6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC172P0C7W6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC172P0C7W6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC172P0C7W6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC172P0C7W6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC172P0C7W6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC172P0C7W6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC172P0C7W6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC172P0C7W6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC172P0C7W6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC172P0C7W6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC172P0C7W6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC172P0C7W6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC172P0C7W6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC172P0C7W6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC172P0C7W6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC172P0C7W6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC172P0C7W6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC172P0C7W6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC172P0C7W6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC172P0C7W6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC172P0C7W6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC172P0C7W6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC172P0C7W6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC172P0C7W6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC172P0C7W6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC172P0C7W6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC172P0C7W6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC172P0C7W6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC172P0C7W6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC172P0C7W6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC172P0C7W6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC172P0C7W6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC172P0C7W6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC172P0C7W6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC172P0C7W6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC172P0C7W6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC172P0C7W6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC172P0C7W6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC172P0C7W6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC172P0C7W6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC172P0C7W6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC172P0C7W6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CCDC172P0C7W6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CCDC172P0C7W6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC172P0C7W6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC172P0C7W6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC172P0C7W6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC172P0C7W6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC172P0C7W6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC172P0C7W6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC172P0C7W6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC172P0C7W6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC172P0C7W6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC172P0C7W6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC172P0C7W6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC172P0C7W6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC172P0C7W6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC172P0C7W6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC172P0C7W6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC172P0C7W6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms