Protein–RNA interactions for Protein: P08574

CYC1, Cytochrome c1, heme protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYC1P08574 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CYC1P08574 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CYC1P08574 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CYC1P08574 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CYC1P08574 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CYC1P08574 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CYC1P08574 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CYC1P08574 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CYC1P08574 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CYC1P08574 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CYC1P08574 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CYC1P08574 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CYC1P08574 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CYC1P08574 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CYC1P08574 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CYC1P08574 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CYC1P08574 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CYC1P08574 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CYC1P08574 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYC1P08574 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYC1P08574 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYC1P08574 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYC1P08574 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYC1P08574 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYC1P08574 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYC1P08574 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYC1P08574 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYC1P08574 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYC1P08574 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYC1P08574 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYC1P08574 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CYC1P08574 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYC1P08574 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYC1P08574 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CYC1P08574 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYC1P08574 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYC1P08574 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYC1P08574 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYC1P08574 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYC1P08574 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYC1P08574 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYC1P08574 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYC1P08574 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CYC1P08574 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYC1P08574 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYC1P08574 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYC1P08574 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CYC1P08574 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYC1P08574 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYC1P08574 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYC1P08574 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYC1P08574 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYC1P08574 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYC1P08574 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CYC1P08574 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYC1P08574 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYC1P08574 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYC1P08574 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CYC1P08574 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CYC1P08574 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CYC1P08574 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CYC1P08574 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CYC1P08574 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CYC1P08574 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CYC1P08574 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CYC1P08574 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CYC1P08574 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CYC1P08574 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CYC1P08574 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CYC1P08574 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CYC1P08574 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CYC1P08574 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CYC1P08574 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CYC1P08574 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CYC1P08574 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CYC1P08574 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CYC1P08574 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CYC1P08574 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CYC1P08574 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CYC1P08574 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CYC1P08574 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CYC1P08574 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CYC1P08574 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CYC1P08574 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CYC1P08574 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CYC1P08574 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CYC1P08574 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CYC1P08574 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CYC1P08574 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CYC1P08574 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CYC1P08574 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CYC1P08574 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CYC1P08574 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CYC1P08574 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CYC1P08574 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CYC1P08574 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
CYC1P08574 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CYC1P08574 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CYC1P08574 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CYC1P08574 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms