Protein–RNA interactions for Protein: P08294

SOD3, Extracellular superoxide dismutase [Cu-Zn], humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOD3P08294 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SOD3P08294 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SOD3P08294 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SOD3P08294 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SOD3P08294 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SOD3P08294 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SOD3P08294 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SOD3P08294 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SOD3P08294 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SOD3P08294 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SOD3P08294 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SOD3P08294 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SOD3P08294 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SOD3P08294 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SOD3P08294 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SOD3P08294 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SOD3P08294 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SOD3P08294 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SOD3P08294 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SOD3P08294 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SOD3P08294 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SOD3P08294 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SOD3P08294 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SOD3P08294 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SOD3P08294 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SOD3P08294 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOD3P08294 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOD3P08294 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SOD3P08294 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SOD3P08294 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SOD3P08294 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SOD3P08294 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SOD3P08294 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SOD3P08294 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SOD3P08294 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SOD3P08294 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SOD3P08294 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SOD3P08294 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SOD3P08294 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SOD3P08294 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SOD3P08294 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SOD3P08294 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SOD3P08294 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SOD3P08294 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SOD3P08294 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SOD3P08294 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SOD3P08294 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SOD3P08294 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SOD3P08294 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SOD3P08294 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SOD3P08294 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SOD3P08294 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOD3P08294 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOD3P08294 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOD3P08294 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOD3P08294 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOD3P08294 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SOD3P08294 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SOD3P08294 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SOD3P08294 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SOD3P08294 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SOD3P08294 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SOD3P08294 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SOD3P08294 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SOD3P08294 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SOD3P08294 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SOD3P08294 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SOD3P08294 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SOD3P08294 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SOD3P08294 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SOD3P08294 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SOD3P08294 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SOD3P08294 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SOD3P08294 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SOD3P08294 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SOD3P08294 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SOD3P08294 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SOD3P08294 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SOD3P08294 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SOD3P08294 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SOD3P08294 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SOD3P08294 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SOD3P08294 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SOD3P08294 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SOD3P08294 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SOD3P08294 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SOD3P08294 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SOD3P08294 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SOD3P08294 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SOD3P08294 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SOD3P08294 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOD3P08294 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOD3P08294 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOD3P08294 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOD3P08294 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SOD3P08294 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SOD3P08294 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SOD3P08294 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SOD3P08294 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SOD3P08294 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms