Protein–RNA interactions for Protein: P02545

LMNA, Prelamin-A/C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNAP02545 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LMNAP02545 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LMNAP02545 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LMNAP02545 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LMNAP02545 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LMNAP02545 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LMNAP02545 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LMNAP02545 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LMNAP02545 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LMNAP02545 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LMNAP02545 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LMNAP02545 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
LMNAP02545 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
LMNAP02545 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LMNAP02545 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LMNAP02545 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LMNAP02545 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LMNAP02545 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LMNAP02545 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LMNAP02545 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LMNAP02545 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
LMNAP02545 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LMNAP02545 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LMNAP02545 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
LMNAP02545 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LMNAP02545 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LMNAP02545 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
LMNAP02545 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LMNAP02545 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LMNAP02545 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LMNAP02545 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LMNAP02545 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LMNAP02545 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LMNAP02545 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LMNAP02545 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LMNAP02545 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LMNAP02545 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LMNAP02545 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LMNAP02545 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LMNAP02545 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LMNAP02545 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
LMNAP02545 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LMNAP02545 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LMNAP02545 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LMNAP02545 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LMNAP02545 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LMNAP02545 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LMNAP02545 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LMNAP02545 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LMNAP02545 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LMNAP02545 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LMNAP02545 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LMNAP02545 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LMNAP02545 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LMNAP02545 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LMNAP02545 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LMNAP02545 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LMNAP02545 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LMNAP02545 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LMNAP02545 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LMNAP02545 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LMNAP02545 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LMNAP02545 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LMNAP02545 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LMNAP02545 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LMNAP02545 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LMNAP02545 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LMNAP02545 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LMNAP02545 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LMNAP02545 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LMNAP02545 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
LMNAP02545 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LMNAP02545 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LMNAP02545 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LMNAP02545 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LMNAP02545 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LMNAP02545 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LMNAP02545 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LMNAP02545 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LMNAP02545 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LMNAP02545 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LMNAP02545 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LMNAP02545 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
LMNAP02545 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LMNAP02545 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LMNAP02545 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LMNAP02545 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LMNAP02545 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LMNAP02545 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LMNAP02545 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LMNAP02545 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LMNAP02545 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LMNAP02545 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LMNAP02545 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
LMNAP02545 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LMNAP02545 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LMNAP02545 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
LMNAP02545 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LMNAP02545 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LMNAP02545 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.3 ms