Protein–RNA interactions for Protein: P01861

IGHG4, Immunoglobulin heavy constant gamma 4, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHG4P01861 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGHG4P01861 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGHG4P01861 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGHG4P01861 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGHG4P01861 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGHG4P01861 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
IGHG4P01861 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
IGHG4P01861 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IGHG4P01861 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
IGHG4P01861 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IGHG4P01861 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IGHG4P01861 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
IGHG4P01861 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IGHG4P01861 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IGHG4P01861 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IGHG4P01861 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
IGHG4P01861 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.3■■□□□ 1
IGHG4P01861 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
IGHG4P01861 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
IGHG4P01861 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IGHG4P01861 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IGHG4P01861 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IGHG4P01861 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IGHG4P01861 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IGHG4P01861 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
IGHG4P01861 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
IGHG4P01861 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IGHG4P01861 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
IGHG4P01861 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IGHG4P01861 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IGHG4P01861 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IGHG4P01861 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IGHG4P01861 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IGHG4P01861 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IGHG4P01861 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IGHG4P01861 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IGHG4P01861 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IGHG4P01861 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IGHG4P01861 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IGHG4P01861 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IGHG4P01861 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IGHG4P01861 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IGHG4P01861 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IGHG4P01861 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IGHG4P01861 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IGHG4P01861 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IGHG4P01861 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IGHG4P01861 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IGHG4P01861 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IGHG4P01861 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
IGHG4P01861 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
IGHG4P01861 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IGHG4P01861 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
IGHG4P01861 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IGHG4P01861 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IGHG4P01861 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IGHG4P01861 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IGHG4P01861 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IGHG4P01861 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IGHG4P01861 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IGHG4P01861 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
IGHG4P01861 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IGHG4P01861 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IGHG4P01861 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IGHG4P01861 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
IGHG4P01861 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
IGHG4P01861 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
IGHG4P01861 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
IGHG4P01861 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IGHG4P01861 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IGHG4P01861 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
IGHG4P01861 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IGHG4P01861 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IGHG4P01861 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IGHG4P01861 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IGHG4P01861 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IGHG4P01861 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IGHG4P01861 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IGHG4P01861 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IGHG4P01861 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IGHG4P01861 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IGHG4P01861 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
IGHG4P01861 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
IGHG4P01861 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
IGHG4P01861 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IGHG4P01861 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
IGHG4P01861 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IGHG4P01861 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IGHG4P01861 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21■□□□□ 0.95
IGHG4P01861 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
IGHG4P01861 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IGHG4P01861 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IGHG4P01861 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
IGHG4P01861 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IGHG4P01861 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
IGHG4P01861 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
IGHG4P01861 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IGHG4P01861 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
IGHG4P01861 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IGHG4P01861 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms