Protein–RNA interactions for Protein: O95628

CNOT4, CCR4-NOT transcription complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT4O95628 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNOT4O95628 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNOT4O95628 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CNOT4O95628 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNOT4O95628 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNOT4O95628 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNOT4O95628 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNOT4O95628 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNOT4O95628 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNOT4O95628 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNOT4O95628 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNOT4O95628 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNOT4O95628 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNOT4O95628 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNOT4O95628 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNOT4O95628 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNOT4O95628 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNOT4O95628 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNOT4O95628 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNOT4O95628 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNOT4O95628 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
CNOT4O95628 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNOT4O95628 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CNOT4O95628 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNOT4O95628 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNOT4O95628 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNOT4O95628 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CNOT4O95628 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNOT4O95628 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNOT4O95628 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNOT4O95628 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNOT4O95628 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNOT4O95628 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNOT4O95628 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNOT4O95628 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNOT4O95628 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNOT4O95628 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNOT4O95628 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNOT4O95628 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNOT4O95628 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CNOT4O95628 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNOT4O95628 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CNOT4O95628 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CNOT4O95628 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CNOT4O95628 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CNOT4O95628 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNOT4O95628 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNOT4O95628 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNOT4O95628 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNOT4O95628 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CNOT4O95628 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNOT4O95628 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNOT4O95628 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNOT4O95628 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNOT4O95628 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNOT4O95628 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNOT4O95628 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNOT4O95628 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNOT4O95628 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNOT4O95628 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CNOT4O95628 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CNOT4O95628 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNOT4O95628 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNOT4O95628 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CNOT4O95628 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNOT4O95628 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNOT4O95628 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNOT4O95628 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNOT4O95628 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNOT4O95628 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNOT4O95628 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNOT4O95628 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNOT4O95628 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNOT4O95628 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNOT4O95628 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNOT4O95628 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNOT4O95628 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNOT4O95628 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNOT4O95628 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNOT4O95628 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNOT4O95628 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNOT4O95628 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNOT4O95628 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNOT4O95628 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CNOT4O95628 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNOT4O95628 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CNOT4O95628 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNOT4O95628 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNOT4O95628 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNOT4O95628 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNOT4O95628 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNOT4O95628 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNOT4O95628 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNOT4O95628 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNOT4O95628 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNOT4O95628 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNOT4O95628 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNOT4O95628 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNOT4O95628 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNOT4O95628 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms