Protein–RNA interactions for Protein: O95273

CCNDBP1, Cyclin-D1-binding protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1O95273 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCNDBP1O95273 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CCNDBP1O95273 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCNDBP1O95273 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCNDBP1O95273 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCNDBP1O95273 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCNDBP1O95273 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCNDBP1O95273 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCNDBP1O95273 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCNDBP1O95273 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCNDBP1O95273 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCNDBP1O95273 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCNDBP1O95273 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCNDBP1O95273 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCNDBP1O95273 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCNDBP1O95273 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCNDBP1O95273 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCNDBP1O95273 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CCNDBP1O95273 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCNDBP1O95273 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCNDBP1O95273 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCNDBP1O95273 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCNDBP1O95273 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCNDBP1O95273 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCNDBP1O95273 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCNDBP1O95273 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCNDBP1O95273 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCNDBP1O95273 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCNDBP1O95273 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCNDBP1O95273 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCNDBP1O95273 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CCNDBP1O95273 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCNDBP1O95273 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCNDBP1O95273 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCNDBP1O95273 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCNDBP1O95273 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCNDBP1O95273 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCNDBP1O95273 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCNDBP1O95273 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCNDBP1O95273 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCNDBP1O95273 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCNDBP1O95273 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCNDBP1O95273 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCNDBP1O95273 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CCNDBP1O95273 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCNDBP1O95273 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCNDBP1O95273 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCNDBP1O95273 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCNDBP1O95273 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCNDBP1O95273 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCNDBP1O95273 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CCNDBP1O95273 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCNDBP1O95273 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCNDBP1O95273 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCNDBP1O95273 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCNDBP1O95273 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCNDBP1O95273 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCNDBP1O95273 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCNDBP1O95273 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCNDBP1O95273 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCNDBP1O95273 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCNDBP1O95273 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCNDBP1O95273 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCNDBP1O95273 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCNDBP1O95273 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCNDBP1O95273 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCNDBP1O95273 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCNDBP1O95273 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCNDBP1O95273 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCNDBP1O95273 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CCNDBP1O95273 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCNDBP1O95273 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCNDBP1O95273 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCNDBP1O95273 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCNDBP1O95273 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCNDBP1O95273 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCNDBP1O95273 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCNDBP1O95273 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCNDBP1O95273 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCNDBP1O95273 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCNDBP1O95273 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCNDBP1O95273 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCNDBP1O95273 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCNDBP1O95273 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCNDBP1O95273 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCNDBP1O95273 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCNDBP1O95273 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCNDBP1O95273 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCNDBP1O95273 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCNDBP1O95273 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCNDBP1O95273 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCNDBP1O95273 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCNDBP1O95273 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCNDBP1O95273 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCNDBP1O95273 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCNDBP1O95273 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCNDBP1O95273 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCNDBP1O95273 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCNDBP1O95273 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCNDBP1O95273 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
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