Protein–RNA interactions for Protein: O95206

PCDH8, Protocadherin-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH8O95206 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PCDH8O95206 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PCDH8O95206 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PCDH8O95206 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PCDH8O95206 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PCDH8O95206 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PCDH8O95206 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PCDH8O95206 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PCDH8O95206 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PCDH8O95206 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PCDH8O95206 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PCDH8O95206 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PCDH8O95206 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PCDH8O95206 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PCDH8O95206 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PCDH8O95206 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PCDH8O95206 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PCDH8O95206 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PCDH8O95206 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PCDH8O95206 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PCDH8O95206 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PCDH8O95206 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PCDH8O95206 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PCDH8O95206 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PCDH8O95206 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PCDH8O95206 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PCDH8O95206 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PCDH8O95206 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PCDH8O95206 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PCDH8O95206 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PCDH8O95206 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PCDH8O95206 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PCDH8O95206 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PCDH8O95206 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PCDH8O95206 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PCDH8O95206 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PCDH8O95206 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PCDH8O95206 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PCDH8O95206 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PCDH8O95206 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PCDH8O95206 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCDH8O95206 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PCDH8O95206 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PCDH8O95206 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PCDH8O95206 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PCDH8O95206 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PCDH8O95206 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PCDH8O95206 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PCDH8O95206 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PCDH8O95206 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PCDH8O95206 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PCDH8O95206 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PCDH8O95206 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PCDH8O95206 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PCDH8O95206 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PCDH8O95206 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PCDH8O95206 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PCDH8O95206 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PCDH8O95206 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PCDH8O95206 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PCDH8O95206 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PCDH8O95206 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PCDH8O95206 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PCDH8O95206 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PCDH8O95206 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PCDH8O95206 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PCDH8O95206 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PCDH8O95206 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PCDH8O95206 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PCDH8O95206 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PCDH8O95206 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PCDH8O95206 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PCDH8O95206 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PCDH8O95206 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PCDH8O95206 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PCDH8O95206 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCDH8O95206 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCDH8O95206 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCDH8O95206 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PCDH8O95206 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PCDH8O95206 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PCDH8O95206 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PCDH8O95206 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCDH8O95206 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCDH8O95206 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCDH8O95206 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCDH8O95206 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PCDH8O95206 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PCDH8O95206 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCDH8O95206 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCDH8O95206 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCDH8O95206 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCDH8O95206 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCDH8O95206 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PCDH8O95206 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCDH8O95206 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCDH8O95206 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCDH8O95206 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCDH8O95206 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCDH8O95206 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.3 ms