Protein–RNA interactions for Protein: O95139

NDUFB6, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFB6O95139 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NDUFB6O95139 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NDUFB6O95139 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NDUFB6O95139 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDUFB6O95139 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDUFB6O95139 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NDUFB6O95139 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NDUFB6O95139 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NDUFB6O95139 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NDUFB6O95139 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NDUFB6O95139 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NDUFB6O95139 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDUFB6O95139 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDUFB6O95139 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDUFB6O95139 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDUFB6O95139 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDUFB6O95139 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDUFB6O95139 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDUFB6O95139 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDUFB6O95139 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDUFB6O95139 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDUFB6O95139 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDUFB6O95139 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDUFB6O95139 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDUFB6O95139 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDUFB6O95139 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDUFB6O95139 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDUFB6O95139 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDUFB6O95139 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDUFB6O95139 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDUFB6O95139 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDUFB6O95139 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NDUFB6O95139 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDUFB6O95139 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NDUFB6O95139 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDUFB6O95139 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDUFB6O95139 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDUFB6O95139 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDUFB6O95139 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDUFB6O95139 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NDUFB6O95139 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NDUFB6O95139 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NDUFB6O95139 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NDUFB6O95139 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDUFB6O95139 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDUFB6O95139 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NDUFB6O95139 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NDUFB6O95139 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NDUFB6O95139 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NDUFB6O95139 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDUFB6O95139 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDUFB6O95139 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDUFB6O95139 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NDUFB6O95139 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDUFB6O95139 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDUFB6O95139 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDUFB6O95139 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDUFB6O95139 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDUFB6O95139 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDUFB6O95139 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDUFB6O95139 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDUFB6O95139 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDUFB6O95139 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDUFB6O95139 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDUFB6O95139 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDUFB6O95139 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDUFB6O95139 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDUFB6O95139 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDUFB6O95139 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDUFB6O95139 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDUFB6O95139 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDUFB6O95139 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDUFB6O95139 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDUFB6O95139 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDUFB6O95139 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDUFB6O95139 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDUFB6O95139 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDUFB6O95139 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDUFB6O95139 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDUFB6O95139 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDUFB6O95139 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NDUFB6O95139 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDUFB6O95139 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDUFB6O95139 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDUFB6O95139 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDUFB6O95139 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDUFB6O95139 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDUFB6O95139 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDUFB6O95139 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDUFB6O95139 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDUFB6O95139 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDUFB6O95139 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDUFB6O95139 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NDUFB6O95139 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NDUFB6O95139 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NDUFB6O95139 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NDUFB6O95139 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDUFB6O95139 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDUFB6O95139 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDUFB6O95139 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms