Protein–RNA interactions for Protein: O94813

SLIT2, Slit homolog 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIT2O94813 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
SLIT2O94813 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
SLIT2O94813 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
SLIT2O94813 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
SLIT2O94813 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
SLIT2O94813 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
SLIT2O94813 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
SLIT2O94813 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
SLIT2O94813 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.57
SLIT2O94813 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
SLIT2O94813 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC37.31■■■■□ 3.56
SLIT2O94813 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
SLIT2O94813 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
SLIT2O94813 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
SLIT2O94813 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC37.26■■■■□ 3.56
SLIT2O94813 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
SLIT2O94813 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC37.25■■■■□ 3.55
SLIT2O94813 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
SLIT2O94813 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
SLIT2O94813 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
SLIT2O94813 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
SLIT2O94813 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC37.2■■■■□ 3.55
SLIT2O94813 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
SLIT2O94813 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
SLIT2O94813 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
SLIT2O94813 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
SLIT2O94813 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC37.13■■■■□ 3.53
SLIT2O94813 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
SLIT2O94813 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC37.12■■■■□ 3.53
SLIT2O94813 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC37.12■■■■□ 3.53
SLIT2O94813 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC37.1■■■■□ 3.53
SLIT2O94813 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
SLIT2O94813 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
SLIT2O94813 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
SLIT2O94813 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC37.09■■■■□ 3.53
SLIT2O94813 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC37.09■■■■□ 3.53
SLIT2O94813 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
SLIT2O94813 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
SLIT2O94813 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC37.08■■■■□ 3.53
SLIT2O94813 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC37.08■■■■□ 3.53
SLIT2O94813 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
SLIT2O94813 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
SLIT2O94813 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
SLIT2O94813 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
SLIT2O94813 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
SLIT2O94813 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
SLIT2O94813 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC37.05■■■■□ 3.52
SLIT2O94813 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
SLIT2O94813 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC37.01■■■■□ 3.52
SLIT2O94813 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
SLIT2O94813 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
SLIT2O94813 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC36.96■■■■□ 3.51
SLIT2O94813 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
SLIT2O94813 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
SLIT2O94813 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
SLIT2O94813 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC36.94■■■■□ 3.5
SLIT2O94813 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
SLIT2O94813 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
SLIT2O94813 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
SLIT2O94813 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
SLIT2O94813 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
SLIT2O94813 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC36.9■■■■□ 3.5
SLIT2O94813 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
SLIT2O94813 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
SLIT2O94813 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
SLIT2O94813 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
SLIT2O94813 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC36.82■■■■□ 3.48
SLIT2O94813 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC36.82■■■■□ 3.48
SLIT2O94813 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC36.81■■■■□ 3.48
SLIT2O94813 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
SLIT2O94813 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
SLIT2O94813 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
SLIT2O94813 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
SLIT2O94813 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
SLIT2O94813 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
SLIT2O94813 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
SLIT2O94813 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
SLIT2O94813 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
SLIT2O94813 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
SLIT2O94813 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
SLIT2O94813 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
SLIT2O94813 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
SLIT2O94813 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC36.75■■■■□ 3.47
SLIT2O94813 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
SLIT2O94813 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
SLIT2O94813 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
SLIT2O94813 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
SLIT2O94813 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
SLIT2O94813 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
SLIT2O94813 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
SLIT2O94813 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
SLIT2O94813 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
SLIT2O94813 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
SLIT2O94813 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
SLIT2O94813 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
SLIT2O94813 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
SLIT2O94813 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
SLIT2O94813 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
SLIT2O94813 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
SLIT2O94813 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms