Protein–RNA interactions for Protein: O75962

TRIO, Triple functional domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,097 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOO75962 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRIOO75962 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
TRIOO75962 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
TRIOO75962 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRIOO75962 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRIOO75962 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRIOO75962 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRIOO75962 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIOO75962 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRIOO75962 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRIOO75962 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRIOO75962 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.16
TRIOO75962 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRIOO75962 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRIOO75962 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRIOO75962 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRIOO75962 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRIOO75962 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRIOO75962 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRIOO75962 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRIOO75962 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
TRIOO75962 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRIOO75962 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRIOO75962 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRIOO75962 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIOO75962 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRIOO75962 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRIOO75962 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRIOO75962 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIOO75962 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIOO75962 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIOO75962 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIOO75962 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIOO75962 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIOO75962 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIOO75962 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIOO75962 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIOO75962 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIOO75962 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIOO75962 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIOO75962 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRIOO75962 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRIOO75962 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRIOO75962 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIOO75962 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIOO75962 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIOO75962 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIOO75962 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIOO75962 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIOO75962 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRIOO75962 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRIOO75962 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRIOO75962 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRIOO75962 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRIOO75962 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIOO75962 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIOO75962 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIOO75962 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIOO75962 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIOO75962 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRIOO75962 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIOO75962 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIOO75962 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
TRIOO75962 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TRIOO75962 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRIOO75962 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIOO75962 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIOO75962 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIOO75962 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRIOO75962 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRIOO75962 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRIOO75962 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRIOO75962 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRIOO75962 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRIOO75962 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TRIOO75962 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIOO75962 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIOO75962 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIOO75962 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIOO75962 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIOO75962 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIOO75962 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIOO75962 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIOO75962 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIOO75962 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIOO75962 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIOO75962 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIOO75962 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIOO75962 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIOO75962 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIOO75962 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIOO75962 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIOO75962 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIOO75962 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
TRIOO75962 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
TRIOO75962 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIOO75962 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIOO75962 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIOO75962 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIOO75962 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms