Protein–RNA interactions for Protein: O75477

ERLIN1, Erlin-1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERLIN1O75477 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ERLIN1O75477 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ERLIN1O75477 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ERLIN1O75477 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ERLIN1O75477 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ERLIN1O75477 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ERLIN1O75477 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ERLIN1O75477 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ERLIN1O75477 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ERLIN1O75477 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ERLIN1O75477 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ERLIN1O75477 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ERLIN1O75477 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ERLIN1O75477 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ERLIN1O75477 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ERLIN1O75477 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ERLIN1O75477 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ERLIN1O75477 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ERLIN1O75477 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ERLIN1O75477 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ERLIN1O75477 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ERLIN1O75477 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ERLIN1O75477 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ERLIN1O75477 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ERLIN1O75477 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ERLIN1O75477 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ERLIN1O75477 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ERLIN1O75477 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ERLIN1O75477 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ERLIN1O75477 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ERLIN1O75477 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ERLIN1O75477 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ERLIN1O75477 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ERLIN1O75477 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ERLIN1O75477 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ERLIN1O75477 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ERLIN1O75477 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ERLIN1O75477 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ERLIN1O75477 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ERLIN1O75477 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ERLIN1O75477 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ERLIN1O75477 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ERLIN1O75477 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ERLIN1O75477 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ERLIN1O75477 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ERLIN1O75477 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ERLIN1O75477 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ERLIN1O75477 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ERLIN1O75477 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
ERLIN1O75477 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ERLIN1O75477 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ERLIN1O75477 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ERLIN1O75477 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ERLIN1O75477 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ERLIN1O75477 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ERLIN1O75477 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ERLIN1O75477 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ERLIN1O75477 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ERLIN1O75477 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ERLIN1O75477 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ERLIN1O75477 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
ERLIN1O75477 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ERLIN1O75477 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
ERLIN1O75477 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ERLIN1O75477 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ERLIN1O75477 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ERLIN1O75477 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ERLIN1O75477 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ERLIN1O75477 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ERLIN1O75477 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ERLIN1O75477 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ERLIN1O75477 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ERLIN1O75477 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ERLIN1O75477 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ERLIN1O75477 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ERLIN1O75477 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ERLIN1O75477 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ERLIN1O75477 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ERLIN1O75477 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ERLIN1O75477 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ERLIN1O75477 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ERLIN1O75477 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ERLIN1O75477 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ERLIN1O75477 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ERLIN1O75477 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ERLIN1O75477 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ERLIN1O75477 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ERLIN1O75477 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ERLIN1O75477 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ERLIN1O75477 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ERLIN1O75477 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ERLIN1O75477 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ERLIN1O75477 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ERLIN1O75477 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ERLIN1O75477 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ERLIN1O75477 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ERLIN1O75477 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ERLIN1O75477 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ERLIN1O75477 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ERLIN1O75477 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.5 ms