Protein–RNA interactions for Protein: O75390

CS, Citrate synthase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSO75390 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CSO75390 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CSO75390 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CSO75390 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CSO75390 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CSO75390 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CSO75390 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CSO75390 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CSO75390 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CSO75390 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CSO75390 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CSO75390 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CSO75390 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CSO75390 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CSO75390 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CSO75390 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CSO75390 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CSO75390 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CSO75390 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CSO75390 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CSO75390 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CSO75390 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CSO75390 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CSO75390 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CSO75390 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CSO75390 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CSO75390 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CSO75390 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CSO75390 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CSO75390 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CSO75390 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CSO75390 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CSO75390 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CSO75390 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CSO75390 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CSO75390 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CSO75390 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CSO75390 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CSO75390 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CSO75390 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CSO75390 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CSO75390 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CSO75390 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CSO75390 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CSO75390 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CSO75390 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CSO75390 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CSO75390 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CSO75390 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CSO75390 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CSO75390 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CSO75390 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CSO75390 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CSO75390 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CSO75390 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CSO75390 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CSO75390 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CSO75390 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CSO75390 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CSO75390 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CSO75390 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CSO75390 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CSO75390 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CSO75390 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CSO75390 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CSO75390 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CSO75390 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CSO75390 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CSO75390 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CSO75390 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CSO75390 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CSO75390 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CSO75390 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CSO75390 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CSO75390 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CSO75390 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CSO75390 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CSO75390 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CSO75390 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CSO75390 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CSO75390 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CSO75390 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CSO75390 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CSO75390 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CSO75390 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CSO75390 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CSO75390 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CSO75390 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CSO75390 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CSO75390 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CSO75390 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CSO75390 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CSO75390 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CSO75390 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CSO75390 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CSO75390 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CSO75390 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CSO75390 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CSO75390 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CSO75390 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms