Protein–RNA interactions for Protein: O75074

LRP3, Low-density lipoprotein receptor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP3O75074 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRP3O75074 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRP3O75074 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRP3O75074 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRP3O75074 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRP3O75074 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRP3O75074 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRP3O75074 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRP3O75074 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRP3O75074 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRP3O75074 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRP3O75074 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRP3O75074 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRP3O75074 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRP3O75074 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
LRP3O75074 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRP3O75074 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRP3O75074 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRP3O75074 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRP3O75074 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRP3O75074 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LRP3O75074 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRP3O75074 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRP3O75074 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRP3O75074 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRP3O75074 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
LRP3O75074 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
LRP3O75074 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRP3O75074 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRP3O75074 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRP3O75074 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRP3O75074 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRP3O75074 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
LRP3O75074 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRP3O75074 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRP3O75074 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRP3O75074 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRP3O75074 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRP3O75074 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
LRP3O75074 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRP3O75074 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRP3O75074 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
LRP3O75074 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRP3O75074 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRP3O75074 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRP3O75074 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRP3O75074 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRP3O75074 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRP3O75074 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRP3O75074 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRP3O75074 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRP3O75074 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRP3O75074 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRP3O75074 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRP3O75074 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRP3O75074 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LRP3O75074 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRP3O75074 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRP3O75074 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
LRP3O75074 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LRP3O75074 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LRP3O75074 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRP3O75074 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRP3O75074 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LRP3O75074 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
LRP3O75074 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRP3O75074 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LRP3O75074 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LRP3O75074 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
LRP3O75074 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LRP3O75074 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
LRP3O75074 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
LRP3O75074 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
LRP3O75074 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRP3O75074 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRP3O75074 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRP3O75074 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
LRP3O75074 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRP3O75074 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
LRP3O75074 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRP3O75074 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRP3O75074 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRP3O75074 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRP3O75074 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LRP3O75074 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LRP3O75074 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRP3O75074 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRP3O75074 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRP3O75074 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRP3O75074 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRP3O75074 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRP3O75074 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRP3O75074 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRP3O75074 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRP3O75074 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRP3O75074 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRP3O75074 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRP3O75074 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRP3O75074 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRP3O75074 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms