Protein–RNA interactions for Protein: O60312

ATP10A, Probable phospholipid-transporting ATPase VA, humanhuman

Predictions only

Length 1,499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP10AO60312 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC41.77■■■■■ 4.28
ATP10AO60312 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
ATP10AO60312 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC41.76■■■■■ 4.28
ATP10AO60312 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC41.75■■■■■ 4.27
ATP10AO60312 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
ATP10AO60312 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
ATP10AO60312 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
ATP10AO60312 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
ATP10AO60312 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC41.72■■■■■ 4.27
ATP10AO60312 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
ATP10AO60312 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
ATP10AO60312 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
ATP10AO60312 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC41.66■■■■■ 4.26
ATP10AO60312 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
ATP10AO60312 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC41.65■■■■■ 4.26
ATP10AO60312 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC41.64■■■■■ 4.26
ATP10AO60312 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
ATP10AO60312 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.26
ATP10AO60312 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
ATP10AO60312 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
ATP10AO60312 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC41.58■■■■■ 4.25
ATP10AO60312 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.25
ATP10AO60312 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.25
ATP10AO60312 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC41.57■■■■■ 4.25
ATP10AO60312 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
ATP10AO60312 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
ATP10AO60312 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
ATP10AO60312 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC41.51■■■■■ 4.24
ATP10AO60312 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
ATP10AO60312 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC41.5■■■■■ 4.23
ATP10AO60312 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC41.49■■■■■ 4.23
ATP10AO60312 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC41.48■■■■■ 4.23
ATP10AO60312 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
ATP10AO60312 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC41.47■■■■■ 4.23
ATP10AO60312 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
ATP10AO60312 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC41.47■■■■■ 4.23
ATP10AO60312 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
ATP10AO60312 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.46■■■■■ 4.23
ATP10AO60312 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
ATP10AO60312 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC41.45■■■■■ 4.23
ATP10AO60312 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC41.45■■■■■ 4.23
ATP10AO60312 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
ATP10AO60312 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC41.44■■■■■ 4.22
ATP10AO60312 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
ATP10AO60312 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC41.41■■■■■ 4.22
ATP10AO60312 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC41.4■■■■■ 4.22
ATP10AO60312 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
ATP10AO60312 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
ATP10AO60312 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.21
ATP10AO60312 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC41.38■■■■■ 4.21
ATP10AO60312 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
ATP10AO60312 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC41.35■■■■■ 4.21
ATP10AO60312 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC41.34■■■■■ 4.21
ATP10AO60312 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC41.33■■■■■ 4.21
ATP10AO60312 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC41.33■■■■■ 4.21
ATP10AO60312 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC41.32■■■■■ 4.2
ATP10AO60312 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC41.31■■■■■ 4.2
ATP10AO60312 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
ATP10AO60312 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
ATP10AO60312 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
ATP10AO60312 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC41.29■■■■■ 4.2
ATP10AO60312 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
ATP10AO60312 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC41.28■■■■■ 4.2
ATP10AO60312 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
ATP10AO60312 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.26■■■■■ 4.2
ATP10AO60312 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
ATP10AO60312 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC41.25■■■■■ 4.19
ATP10AO60312 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
ATP10AO60312 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
ATP10AO60312 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
ATP10AO60312 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
ATP10AO60312 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC41.17■■■■■ 4.18
ATP10AO60312 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
ATP10AO60312 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
ATP10AO60312 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
ATP10AO60312 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
ATP10AO60312 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC41.15■■■■■ 4.18
ATP10AO60312 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.15■■■■■ 4.18
ATP10AO60312 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.14■■■■■ 4.18
ATP10AO60312 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC41.13■■■■■ 4.17
ATP10AO60312 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC41.13■■■■■ 4.17
ATP10AO60312 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC41.11■■■■■ 4.17
ATP10AO60312 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC41.08■■■■■ 4.17
ATP10AO60312 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC41.07■■■■■ 4.16
ATP10AO60312 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
ATP10AO60312 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC41.05■■■■■ 4.16
ATP10AO60312 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC41.05■■■■■ 4.16
ATP10AO60312 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC41.05■■■■■ 4.16
ATP10AO60312 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
ATP10AO60312 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
ATP10AO60312 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC41.02■■■■■ 4.16
ATP10AO60312 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.02■■■■■ 4.16
ATP10AO60312 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.02■■■■■ 4.16
ATP10AO60312 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC41.02■■■■■ 4.16
ATP10AO60312 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC41.02■■■■■ 4.16
ATP10AO60312 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
ATP10AO60312 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC41.01■■■■■ 4.16
ATP10AO60312 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41■■■■■ 4.15
ATP10AO60312 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
ATP10AO60312 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.8 ms