Protein–RNA interactions for Protein: O60279

SUSD5, Sushi domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD5O60279 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SUSD5O60279 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SUSD5O60279 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SUSD5O60279 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SUSD5O60279 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SUSD5O60279 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SUSD5O60279 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SUSD5O60279 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SUSD5O60279 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SUSD5O60279 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SUSD5O60279 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SUSD5O60279 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SUSD5O60279 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SUSD5O60279 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SUSD5O60279 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SUSD5O60279 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SUSD5O60279 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SUSD5O60279 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SUSD5O60279 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SUSD5O60279 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SUSD5O60279 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SUSD5O60279 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SUSD5O60279 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SUSD5O60279 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SUSD5O60279 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SUSD5O60279 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SUSD5O60279 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SUSD5O60279 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SUSD5O60279 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SUSD5O60279 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SUSD5O60279 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SUSD5O60279 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SUSD5O60279 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SUSD5O60279 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SUSD5O60279 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SUSD5O60279 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SUSD5O60279 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SUSD5O60279 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SUSD5O60279 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SUSD5O60279 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SUSD5O60279 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SUSD5O60279 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SUSD5O60279 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SUSD5O60279 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SUSD5O60279 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SUSD5O60279 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SUSD5O60279 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SUSD5O60279 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SUSD5O60279 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SUSD5O60279 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SUSD5O60279 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SUSD5O60279 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SUSD5O60279 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SUSD5O60279 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SUSD5O60279 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SUSD5O60279 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SUSD5O60279 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SUSD5O60279 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SUSD5O60279 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SUSD5O60279 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SUSD5O60279 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SUSD5O60279 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SUSD5O60279 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SUSD5O60279 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SUSD5O60279 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SUSD5O60279 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SUSD5O60279 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SUSD5O60279 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SUSD5O60279 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SUSD5O60279 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SUSD5O60279 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SUSD5O60279 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SUSD5O60279 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SUSD5O60279 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SUSD5O60279 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SUSD5O60279 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SUSD5O60279 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SUSD5O60279 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SUSD5O60279 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SUSD5O60279 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SUSD5O60279 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SUSD5O60279 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SUSD5O60279 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SUSD5O60279 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SUSD5O60279 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SUSD5O60279 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SUSD5O60279 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SUSD5O60279 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SUSD5O60279 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SUSD5O60279 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SUSD5O60279 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SUSD5O60279 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SUSD5O60279 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SUSD5O60279 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SUSD5O60279 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SUSD5O60279 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SUSD5O60279 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SUSD5O60279 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SUSD5O60279 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SUSD5O60279 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms