Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC41.72■■■■■ 4.27
SPAG9O60271 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.71■■■■■ 4.27
SPAG9O60271 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC41.71■■■■■ 4.27
SPAG9O60271 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC41.69■■■■■ 4.26
SPAG9O60271 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
SPAG9O60271 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC41.65■■■■■ 4.26
SPAG9O60271 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
SPAG9O60271 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
SPAG9O60271 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC41.62■■■■■ 4.25
SPAG9O60271 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC41.62■■■■■ 4.25
SPAG9O60271 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
SPAG9O60271 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
SPAG9O60271 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
SPAG9O60271 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
SPAG9O60271 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC41.59■■■■■ 4.25
SPAG9O60271 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC41.57■■■■■ 4.25
SPAG9O60271 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC41.56■■■■■ 4.24
SPAG9O60271 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
SPAG9O60271 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC41.55■■■■■ 4.24
SPAG9O60271 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
SPAG9O60271 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
SPAG9O60271 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
SPAG9O60271 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
SPAG9O60271 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC41.51■■■■■ 4.24
SPAG9O60271 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
SPAG9O60271 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC41.47■■■■■ 4.23
SPAG9O60271 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC41.47■■■■■ 4.23
SPAG9O60271 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
SPAG9O60271 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
SPAG9O60271 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
SPAG9O60271 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
SPAG9O60271 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
SPAG9O60271 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
SPAG9O60271 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.41■■■■■ 4.22
SPAG9O60271 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
SPAG9O60271 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC41.39■■■■■ 4.22
SPAG9O60271 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.39■■■■■ 4.22
SPAG9O60271 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.21
SPAG9O60271 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
SPAG9O60271 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC41.34■■■■■ 4.21
SPAG9O60271 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
SPAG9O60271 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC41.33■■■■■ 4.21
SPAG9O60271 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC41.33■■■■■ 4.21
SPAG9O60271 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.21
SPAG9O60271 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.21
SPAG9O60271 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC41.32■■■■■ 4.21
SPAG9O60271 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
SPAG9O60271 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
SPAG9O60271 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
SPAG9O60271 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
SPAG9O60271 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC41.28■■■■■ 4.2
SPAG9O60271 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
SPAG9O60271 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC41.25■■■■■ 4.19
SPAG9O60271 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
SPAG9O60271 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC41.22■■■■■ 4.19
SPAG9O60271 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
SPAG9O60271 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC41.21■■■■■ 4.19
SPAG9O60271 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC41.21■■■■■ 4.19
SPAG9O60271 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC41.19■■■■■ 4.19
SPAG9O60271 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
SPAG9O60271 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.17■■■■■ 4.18
SPAG9O60271 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
SPAG9O60271 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
SPAG9O60271 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
SPAG9O60271 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
SPAG9O60271 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC41.14■■■■■ 4.18
SPAG9O60271 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
SPAG9O60271 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC41.11■■■■■ 4.17
SPAG9O60271 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
SPAG9O60271 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC41.09■■■■■ 4.17
SPAG9O60271 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
SPAG9O60271 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.08■■■■■ 4.17
SPAG9O60271 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
SPAG9O60271 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
SPAG9O60271 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC41.06■■■■■ 4.16
SPAG9O60271 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC41.05■■■■■ 4.16
SPAG9O60271 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC41.05■■■■■ 4.16
SPAG9O60271 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
SPAG9O60271 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC41.03■■■■■ 4.16
SPAG9O60271 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
SPAG9O60271 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
SPAG9O60271 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
SPAG9O60271 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC40.98■■■■■ 4.15
SPAG9O60271 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC40.96■■■■■ 4.15
SPAG9O60271 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC40.96■■■■■ 4.15
SPAG9O60271 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC40.94■■■■■ 4.15
SPAG9O60271 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
SPAG9O60271 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC40.93■■■■■ 4.14
SPAG9O60271 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC40.93■■■■■ 4.14
SPAG9O60271 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC40.92■■■■■ 4.14
SPAG9O60271 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.91■■■■■ 4.14
SPAG9O60271 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
SPAG9O60271 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC40.91■■■■■ 4.14
SPAG9O60271 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.9■■■■■ 4.14
SPAG9O60271 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
SPAG9O60271 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC40.9■■■■■ 4.14
SPAG9O60271 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC40.9■■■■■ 4.14
SPAG9O60271 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
SPAG9O60271 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC40.89■■■■■ 4.14
SPAG9O60271 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
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