Protein–RNA interactions for Protein: O43246

SLC7A4, Cationic amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC7A4O43246 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC7A4O43246 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC7A4O43246 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SLC7A4O43246 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SLC7A4O43246 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC7A4O43246 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC7A4O43246 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC7A4O43246 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC7A4O43246 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC7A4O43246 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC7A4O43246 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC7A4O43246 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SLC7A4O43246 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SLC7A4O43246 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC7A4O43246 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC7A4O43246 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC7A4O43246 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC7A4O43246 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC7A4O43246 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC7A4O43246 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC7A4O43246 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC7A4O43246 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC7A4O43246 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC7A4O43246 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC7A4O43246 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC7A4O43246 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC7A4O43246 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC7A4O43246 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC7A4O43246 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SLC7A4O43246 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SLC7A4O43246 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SLC7A4O43246 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLC7A4O43246 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SLC7A4O43246 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
SLC7A4O43246 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SLC7A4O43246 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SLC7A4O43246 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SLC7A4O43246 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SLC7A4O43246 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SLC7A4O43246 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLC7A4O43246 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SLC7A4O43246 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLC7A4O43246 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SLC7A4O43246 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC7A4O43246 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC7A4O43246 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC7A4O43246 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC7A4O43246 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC7A4O43246 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC7A4O43246 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC7A4O43246 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC7A4O43246 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC7A4O43246 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLC7A4O43246 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLC7A4O43246 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SLC7A4O43246 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC7A4O43246 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC7A4O43246 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC7A4O43246 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC7A4O43246 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC7A4O43246 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC7A4O43246 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC7A4O43246 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC7A4O43246 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC7A4O43246 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC7A4O43246 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
SLC7A4O43246 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC7A4O43246 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC7A4O43246 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC7A4O43246 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC7A4O43246 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC7A4O43246 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC7A4O43246 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC7A4O43246 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC7A4O43246 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC7A4O43246 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC7A4O43246 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC7A4O43246 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC7A4O43246 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC7A4O43246 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC7A4O43246 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC7A4O43246 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC7A4O43246 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC7A4O43246 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC7A4O43246 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC7A4O43246 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC7A4O43246 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC7A4O43246 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC7A4O43246 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC7A4O43246 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC7A4O43246 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC7A4O43246 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC7A4O43246 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC7A4O43246 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC7A4O43246 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC7A4O43246 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC7A4O43246 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC7A4O43246 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC7A4O43246 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC7A4O43246 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms