Protein–RNA interactions for Protein: O15504

NUPL2, Nucleoporin-like protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUPL2O15504 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUPL2O15504 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUPL2O15504 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUPL2O15504 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUPL2O15504 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUPL2O15504 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUPL2O15504 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUPL2O15504 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUPL2O15504 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUPL2O15504 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUPL2O15504 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUPL2O15504 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUPL2O15504 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUPL2O15504 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUPL2O15504 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUPL2O15504 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NUPL2O15504 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUPL2O15504 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUPL2O15504 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUPL2O15504 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUPL2O15504 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUPL2O15504 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUPL2O15504 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUPL2O15504 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUPL2O15504 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUPL2O15504 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUPL2O15504 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUPL2O15504 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUPL2O15504 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUPL2O15504 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUPL2O15504 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUPL2O15504 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUPL2O15504 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUPL2O15504 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUPL2O15504 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUPL2O15504 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUPL2O15504 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUPL2O15504 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUPL2O15504 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUPL2O15504 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUPL2O15504 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUPL2O15504 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUPL2O15504 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NUPL2O15504 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUPL2O15504 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUPL2O15504 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUPL2O15504 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUPL2O15504 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUPL2O15504 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUPL2O15504 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUPL2O15504 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUPL2O15504 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUPL2O15504 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NUPL2O15504 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUPL2O15504 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUPL2O15504 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUPL2O15504 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NUPL2O15504 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUPL2O15504 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUPL2O15504 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUPL2O15504 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUPL2O15504 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NUPL2O15504 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NUPL2O15504 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NUPL2O15504 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NUPL2O15504 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NUPL2O15504 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUPL2O15504 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUPL2O15504 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUPL2O15504 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUPL2O15504 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUPL2O15504 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUPL2O15504 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUPL2O15504 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUPL2O15504 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUPL2O15504 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUPL2O15504 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUPL2O15504 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUPL2O15504 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUPL2O15504 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUPL2O15504 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUPL2O15504 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUPL2O15504 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUPL2O15504 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUPL2O15504 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUPL2O15504 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUPL2O15504 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUPL2O15504 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NUPL2O15504 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NUPL2O15504 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUPL2O15504 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUPL2O15504 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NUPL2O15504 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NUPL2O15504 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUPL2O15504 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUPL2O15504 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUPL2O15504 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUPL2O15504 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUPL2O15504 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUPL2O15504 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms