Protein–RNA interactions for Protein: O15105

SMAD7, Mothers against decapentaplegic homolog 7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD7O15105 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMAD7O15105 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMAD7O15105 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMAD7O15105 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMAD7O15105 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMAD7O15105 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMAD7O15105 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMAD7O15105 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMAD7O15105 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMAD7O15105 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMAD7O15105 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMAD7O15105 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMAD7O15105 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMAD7O15105 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SMAD7O15105 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMAD7O15105 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMAD7O15105 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMAD7O15105 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SMAD7O15105 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMAD7O15105 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMAD7O15105 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMAD7O15105 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMAD7O15105 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMAD7O15105 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMAD7O15105 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMAD7O15105 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMAD7O15105 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMAD7O15105 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMAD7O15105 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SMAD7O15105 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMAD7O15105 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMAD7O15105 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMAD7O15105 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMAD7O15105 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMAD7O15105 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SMAD7O15105 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMAD7O15105 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SMAD7O15105 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMAD7O15105 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMAD7O15105 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMAD7O15105 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMAD7O15105 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SMAD7O15105 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMAD7O15105 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMAD7O15105 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMAD7O15105 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMAD7O15105 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMAD7O15105 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMAD7O15105 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMAD7O15105 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMAD7O15105 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMAD7O15105 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMAD7O15105 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMAD7O15105 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMAD7O15105 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMAD7O15105 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMAD7O15105 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SMAD7O15105 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMAD7O15105 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMAD7O15105 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMAD7O15105 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SMAD7O15105 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMAD7O15105 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMAD7O15105 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMAD7O15105 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMAD7O15105 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMAD7O15105 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMAD7O15105 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMAD7O15105 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMAD7O15105 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SMAD7O15105 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SMAD7O15105 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMAD7O15105 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMAD7O15105 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMAD7O15105 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMAD7O15105 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMAD7O15105 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMAD7O15105 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMAD7O15105 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMAD7O15105 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMAD7O15105 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMAD7O15105 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SMAD7O15105 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SMAD7O15105 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMAD7O15105 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMAD7O15105 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMAD7O15105 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMAD7O15105 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMAD7O15105 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMAD7O15105 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMAD7O15105 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMAD7O15105 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMAD7O15105 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMAD7O15105 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMAD7O15105 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMAD7O15105 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMAD7O15105 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMAD7O15105 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMAD7O15105 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SMAD7O15105 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms