Protein–RNA interactions for Protein: O15068

MCF2L, Guanine nucleotide exchange factor DBS, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2LO15068 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
MCF2LO15068 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MCF2LO15068 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MCF2LO15068 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MCF2LO15068 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MCF2LO15068 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MCF2LO15068 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MCF2LO15068 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MCF2LO15068 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MCF2LO15068 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
MCF2LO15068 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MCF2LO15068 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MCF2LO15068 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MCF2LO15068 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MCF2LO15068 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MCF2LO15068 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MCF2LO15068 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MCF2LO15068 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MCF2LO15068 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MCF2LO15068 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MCF2LO15068 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MCF2LO15068 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MCF2LO15068 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MCF2LO15068 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MCF2LO15068 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MCF2LO15068 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MCF2LO15068 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MCF2LO15068 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MCF2LO15068 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MCF2LO15068 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MCF2LO15068 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MCF2LO15068 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MCF2LO15068 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MCF2LO15068 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MCF2LO15068 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MCF2LO15068 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MCF2LO15068 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MCF2LO15068 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MCF2LO15068 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MCF2LO15068 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MCF2LO15068 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MCF2LO15068 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
MCF2LO15068 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MCF2LO15068 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MCF2LO15068 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MCF2LO15068 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
MCF2LO15068 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MCF2LO15068 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MCF2LO15068 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MCF2LO15068 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MCF2LO15068 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MCF2LO15068 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
MCF2LO15068 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MCF2LO15068 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MCF2LO15068 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MCF2LO15068 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MCF2LO15068 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MCF2LO15068 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
MCF2LO15068 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MCF2LO15068 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MCF2LO15068 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MCF2LO15068 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
MCF2LO15068 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MCF2LO15068 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MCF2LO15068 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MCF2LO15068 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MCF2LO15068 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
MCF2LO15068 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MCF2LO15068 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MCF2LO15068 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MCF2LO15068 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MCF2LO15068 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MCF2LO15068 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MCF2LO15068 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
MCF2LO15068 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MCF2LO15068 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MCF2LO15068 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MCF2LO15068 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MCF2LO15068 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MCF2LO15068 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MCF2LO15068 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MCF2LO15068 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MCF2LO15068 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MCF2LO15068 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MCF2LO15068 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MCF2LO15068 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MCF2LO15068 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MCF2LO15068 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MCF2LO15068 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
MCF2LO15068 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MCF2LO15068 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MCF2LO15068 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MCF2LO15068 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MCF2LO15068 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MCF2LO15068 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
MCF2LO15068 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
MCF2LO15068 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MCF2LO15068 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MCF2LO15068 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MCF2LO15068 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms