Protein–RNA interactions for Protein: O15055

PER2, Period circadian protein homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PER2O15055 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
PER2O15055 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PER2O15055 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PER2O15055 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PER2O15055 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PER2O15055 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PER2O15055 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PER2O15055 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PER2O15055 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PER2O15055 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PER2O15055 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PER2O15055 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PER2O15055 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PER2O15055 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PER2O15055 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PER2O15055 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PER2O15055 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PER2O15055 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
PER2O15055 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PER2O15055 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PER2O15055 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PER2O15055 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PER2O15055 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PER2O15055 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PER2O15055 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PER2O15055 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PER2O15055 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PER2O15055 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PER2O15055 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PER2O15055 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PER2O15055 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PER2O15055 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PER2O15055 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PER2O15055 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PER2O15055 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PER2O15055 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PER2O15055 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PER2O15055 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PER2O15055 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PER2O15055 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PER2O15055 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
PER2O15055 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PER2O15055 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PER2O15055 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PER2O15055 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PER2O15055 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PER2O15055 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PER2O15055 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PER2O15055 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PER2O15055 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PER2O15055 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PER2O15055 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PER2O15055 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PER2O15055 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PER2O15055 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PER2O15055 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PER2O15055 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PER2O15055 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PER2O15055 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PER2O15055 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PER2O15055 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PER2O15055 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PER2O15055 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
PER2O15055 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PER2O15055 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PER2O15055 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PER2O15055 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PER2O15055 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PER2O15055 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PER2O15055 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PER2O15055 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PER2O15055 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
PER2O15055 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PER2O15055 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PER2O15055 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
PER2O15055 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PER2O15055 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PER2O15055 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PER2O15055 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PER2O15055 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PER2O15055 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PER2O15055 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
PER2O15055 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PER2O15055 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PER2O15055 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PER2O15055 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PER2O15055 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PER2O15055 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PER2O15055 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PER2O15055 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PER2O15055 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
PER2O15055 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PER2O15055 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PER2O15055 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PER2O15055 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PER2O15055 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
PER2O15055 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
PER2O15055 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
PER2O15055 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PER2O15055 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms