Protein–RNA interactions for Protein: O00592

PODXL, Podocalyxin, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXLO00592 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PODXLO00592 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PODXLO00592 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PODXLO00592 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PODXLO00592 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PODXLO00592 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PODXLO00592 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PODXLO00592 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PODXLO00592 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PODXLO00592 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PODXLO00592 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PODXLO00592 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
PODXLO00592 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PODXLO00592 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PODXLO00592 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PODXLO00592 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PODXLO00592 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PODXLO00592 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PODXLO00592 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
PODXLO00592 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
PODXLO00592 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PODXLO00592 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PODXLO00592 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PODXLO00592 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PODXLO00592 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PODXLO00592 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PODXLO00592 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PODXLO00592 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PODXLO00592 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PODXLO00592 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PODXLO00592 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
PODXLO00592 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
PODXLO00592 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PODXLO00592 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PODXLO00592 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PODXLO00592 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PODXLO00592 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PODXLO00592 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PODXLO00592 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PODXLO00592 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PODXLO00592 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PODXLO00592 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PODXLO00592 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PODXLO00592 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PODXLO00592 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
PODXLO00592 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PODXLO00592 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PODXLO00592 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PODXLO00592 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PODXLO00592 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
PODXLO00592 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PODXLO00592 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PODXLO00592 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PODXLO00592 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PODXLO00592 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PODXLO00592 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PODXLO00592 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PODXLO00592 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PODXLO00592 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
PODXLO00592 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PODXLO00592 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PODXLO00592 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PODXLO00592 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PODXLO00592 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PODXLO00592 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PODXLO00592 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
PODXLO00592 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PODXLO00592 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PODXLO00592 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PODXLO00592 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PODXLO00592 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
PODXLO00592 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PODXLO00592 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PODXLO00592 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PODXLO00592 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
PODXLO00592 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
PODXLO00592 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PODXLO00592 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PODXLO00592 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PODXLO00592 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PODXLO00592 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PODXLO00592 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PODXLO00592 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PODXLO00592 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
PODXLO00592 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PODXLO00592 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
PODXLO00592 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PODXLO00592 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PODXLO00592 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PODXLO00592 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PODXLO00592 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PODXLO00592 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PODXLO00592 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PODXLO00592 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PODXLO00592 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PODXLO00592 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PODXLO00592 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PODXLO00592 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PODXLO00592 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PODXLO00592 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms