Protein–RNA interactions for Protein: H3BQF6

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BQF6 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
H3BQF6 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
H3BQF6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
H3BQF6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
H3BQF6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
H3BQF6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
H3BQF6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
H3BQF6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
H3BQF6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
H3BQF6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
H3BQF6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
H3BQF6 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
H3BQF6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
H3BQF6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
H3BQF6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
H3BQF6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
H3BQF6 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
H3BQF6 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
H3BQF6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
H3BQF6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
H3BQF6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
H3BQF6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
H3BQF6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
H3BQF6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
H3BQF6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
H3BQF6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
H3BQF6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
H3BQF6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
H3BQF6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
H3BQF6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
H3BQF6 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
H3BQF6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
H3BQF6 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
H3BQF6 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
H3BQF6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
H3BQF6 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
H3BQF6 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
H3BQF6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
H3BQF6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
H3BQF6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
H3BQF6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
H3BQF6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
H3BQF6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
H3BQF6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
H3BQF6 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
H3BQF6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
H3BQF6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
H3BQF6 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
H3BQF6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
H3BQF6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
H3BQF6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
H3BQF6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
H3BQF6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
H3BQF6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
H3BQF6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
H3BQF6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
H3BQF6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
H3BQF6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
H3BQF6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
H3BQF6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
H3BQF6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
H3BQF6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
H3BQF6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
H3BQF6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
H3BQF6 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
H3BQF6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
H3BQF6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
H3BQF6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
H3BQF6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
H3BQF6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
H3BQF6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
H3BQF6 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
H3BQF6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
H3BQF6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
H3BQF6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
H3BQF6 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
H3BQF6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
H3BQF6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
H3BQF6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
H3BQF6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
H3BQF6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
H3BQF6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
H3BQF6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
H3BQF6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
H3BQF6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
H3BQF6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
H3BQF6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
H3BQF6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
H3BQF6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
H3BQF6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
H3BQF6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
H3BQF6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
H3BQF6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
H3BQF6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
H3BQF6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
H3BQF6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
H3BQF6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
H3BQF6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
H3BQF6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
H3BQF6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.4 ms